Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Fgd1P52734 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Fgd1P52734 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Fgd1P52734 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Fgd1P52734 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Fgd1P52734 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Fgd1P52734 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Fgd1P52734 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Fgd1P52734 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Fgd1P52734 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Fgd1P52734 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Fgd1P52734 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Fgd1P52734 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Fgd1P52734 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Fgd1P52734 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Fgd1P52734 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Fgd1P52734 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Fgd1P52734 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Fgd1P52734 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Fgd1P52734 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Fgd1P52734 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Fgd1P52734 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Fgd1P52734 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Fgd1P52734 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Fgd1P52734 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Fgd1P52734 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Fgd1P52734 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Fgd1P52734 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Fgd1P52734 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Fgd1P52734 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Fgd1P52734 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fgd1P52734 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fgd1P52734 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fgd1P52734 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fgd1P52734 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fgd1P52734 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fgd1P52734 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Fgd1P52734 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Fgd1P52734 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Fgd1P52734 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Fgd1P52734 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Fgd1P52734 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fgd1P52734 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fgd1P52734 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fgd1P52734 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fgd1P52734 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fgd1P52734 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fgd1P52734 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fgd1P52734 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fgd1P52734 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Fgd1P52734 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Fgd1P52734 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fgd1P52734 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fgd1P52734 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fgd1P52734 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Fgd1P52734 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Fgd1P52734 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Fgd1P52734 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Fgd1P52734 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Fgd1P52734 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Fgd1P52734 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Fgd1P52734 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Fgd1P52734 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Fgd1P52734 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Fgd1P52734 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fgd1P52734 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fgd1P52734 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fgd1P52734 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fgd1P52734 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fgd1P52734 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fgd1P52734 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fgd1P52734 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Fgd1P52734 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Fgd1P52734 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Fgd1P52734 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Fgd1P52734 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Fgd1P52734 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fgd1P52734 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fgd1P52734 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fgd1P52734 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fgd1P52734 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fgd1P52734 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fgd1P52734 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fgd1P52734 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fgd1P52734 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Fgd1P52734 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Fgd1P52734 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Fgd1P52734 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fgd1P52734 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Fgd1P52734 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Fgd1P52734 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Fgd1P52734 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Fgd1P52734 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Fgd1P52734 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Fgd1P52734 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fgd1P52734 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fgd1P52734 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fgd1P52734 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fgd1P52734 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fgd1P52734 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms