Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SftpbP50405 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SftpbP50405 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SftpbP50405 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SftpbP50405 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SftpbP50405 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SftpbP50405 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SftpbP50405 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SftpbP50405 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SftpbP50405 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SftpbP50405 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SftpbP50405 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SftpbP50405 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SftpbP50405 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SftpbP50405 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SftpbP50405 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SftpbP50405 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SftpbP50405 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SftpbP50405 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SftpbP50405 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SftpbP50405 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SftpbP50405 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SftpbP50405 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SftpbP50405 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SftpbP50405 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SftpbP50405 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SftpbP50405 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SftpbP50405 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SftpbP50405 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SftpbP50405 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SftpbP50405 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SftpbP50405 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SftpbP50405 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SftpbP50405 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SftpbP50405 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SftpbP50405 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SftpbP50405 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SftpbP50405 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SftpbP50405 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SftpbP50405 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SftpbP50405 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SftpbP50405 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SftpbP50405 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SftpbP50405 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SftpbP50405 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SftpbP50405 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SftpbP50405 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SftpbP50405 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SftpbP50405 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SftpbP50405 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SftpbP50405 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SftpbP50405 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SftpbP50405 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SftpbP50405 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SftpbP50405 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SftpbP50405 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SftpbP50405 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SftpbP50405 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SftpbP50405 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SftpbP50405 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SftpbP50405 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SftpbP50405 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SftpbP50405 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SftpbP50405 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SftpbP50405 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SftpbP50405 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SftpbP50405 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SftpbP50405 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SftpbP50405 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SftpbP50405 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SftpbP50405 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SftpbP50405 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SftpbP50405 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SftpbP50405 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SftpbP50405 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SftpbP50405 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SftpbP50405 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SftpbP50405 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SftpbP50405 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SftpbP50405 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SftpbP50405 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SftpbP50405 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SftpbP50405 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SftpbP50405 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SftpbP50405 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SftpbP50405 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SftpbP50405 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SftpbP50405 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SftpbP50405 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SftpbP50405 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SftpbP50405 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SftpbP50405 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SftpbP50405 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SftpbP50405 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SftpbP50405 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SftpbP50405 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SftpbP50405 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SftpbP50405 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SftpbP50405 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SftpbP50405 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms