Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hcls1P49710 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hcls1P49710 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hcls1P49710 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hcls1P49710 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hcls1P49710 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hcls1P49710 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hcls1P49710 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hcls1P49710 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hcls1P49710 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hcls1P49710 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hcls1P49710 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hcls1P49710 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hcls1P49710 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Hcls1P49710 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hcls1P49710 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hcls1P49710 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hcls1P49710 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hcls1P49710 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hcls1P49710 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hcls1P49710 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hcls1P49710 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hcls1P49710 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hcls1P49710 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hcls1P49710 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hcls1P49710 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hcls1P49710 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hcls1P49710 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hcls1P49710 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hcls1P49710 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hcls1P49710 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hcls1P49710 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hcls1P49710 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hcls1P49710 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hcls1P49710 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hcls1P49710 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hcls1P49710 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hcls1P49710 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hcls1P49710 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hcls1P49710 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hcls1P49710 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hcls1P49710 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Hcls1P49710 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hcls1P49710 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hcls1P49710 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hcls1P49710 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hcls1P49710 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hcls1P49710 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hcls1P49710 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hcls1P49710 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hcls1P49710 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hcls1P49710 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hcls1P49710 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hcls1P49710 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hcls1P49710 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Hcls1P49710 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hcls1P49710 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hcls1P49710 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hcls1P49710 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hcls1P49710 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hcls1P49710 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hcls1P49710 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hcls1P49710 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hcls1P49710 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hcls1P49710 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hcls1P49710 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hcls1P49710 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hcls1P49710 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hcls1P49710 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hcls1P49710 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hcls1P49710 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hcls1P49710 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hcls1P49710 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hcls1P49710 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hcls1P49710 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hcls1P49710 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hcls1P49710 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hcls1P49710 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hcls1P49710 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hcls1P49710 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hcls1P49710 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hcls1P49710 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hcls1P49710 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hcls1P49710 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hcls1P49710 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hcls1P49710 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hcls1P49710 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hcls1P49710 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hcls1P49710 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hcls1P49710 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hcls1P49710 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hcls1P49710 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hcls1P49710 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hcls1P49710 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hcls1P49710 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hcls1P49710 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hcls1P49710 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hcls1P49710 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hcls1P49710 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hcls1P49710 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms