Protein–RNA interactions for Protein: P47857

Pfkm, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfkmP47857 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PfkmP47857 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PfkmP47857 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PfkmP47857 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PfkmP47857 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PfkmP47857 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PfkmP47857 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PfkmP47857 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PfkmP47857 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PfkmP47857 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PfkmP47857 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PfkmP47857 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PfkmP47857 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PfkmP47857 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PfkmP47857 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PfkmP47857 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PfkmP47857 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PfkmP47857 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PfkmP47857 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PfkmP47857 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PfkmP47857 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PfkmP47857 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PfkmP47857 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PfkmP47857 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PfkmP47857 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PfkmP47857 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PfkmP47857 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PfkmP47857 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PfkmP47857 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PfkmP47857 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PfkmP47857 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PfkmP47857 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PfkmP47857 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PfkmP47857 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PfkmP47857 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PfkmP47857 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PfkmP47857 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PfkmP47857 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PfkmP47857 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PfkmP47857 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PfkmP47857 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PfkmP47857 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PfkmP47857 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PfkmP47857 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PfkmP47857 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PfkmP47857 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PfkmP47857 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PfkmP47857 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PfkmP47857 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PfkmP47857 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PfkmP47857 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PfkmP47857 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PfkmP47857 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PfkmP47857 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PfkmP47857 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PfkmP47857 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PfkmP47857 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PfkmP47857 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PfkmP47857 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PfkmP47857 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PfkmP47857 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PfkmP47857 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PfkmP47857 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PfkmP47857 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PfkmP47857 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PfkmP47857 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PfkmP47857 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PfkmP47857 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PfkmP47857 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PfkmP47857 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PfkmP47857 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PfkmP47857 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PfkmP47857 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PfkmP47857 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PfkmP47857 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PfkmP47857 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PfkmP47857 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PfkmP47857 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PfkmP47857 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PfkmP47857 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PfkmP47857 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PfkmP47857 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PfkmP47857 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PfkmP47857 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PfkmP47857 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PfkmP47857 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PfkmP47857 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PfkmP47857 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PfkmP47857 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PfkmP47857 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PfkmP47857 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PfkmP47857 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PfkmP47857 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PfkmP47857 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PfkmP47857 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PfkmP47857 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PfkmP47857 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PfkmP47857 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PfkmP47857 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PfkmP47857 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms