Protein–RNA interactions for Protein: P43006

Slc1a2, Excitatory amino acid transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a2P43006 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc1a2P43006 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc1a2P43006 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc1a2P43006 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc1a2P43006 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc1a2P43006 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc1a2P43006 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc1a2P43006 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc1a2P43006 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc1a2P43006 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc1a2P43006 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc1a2P43006 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc1a2P43006 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc1a2P43006 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc1a2P43006 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc1a2P43006 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc1a2P43006 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc1a2P43006 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc1a2P43006 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc1a2P43006 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc1a2P43006 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc1a2P43006 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc1a2P43006 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc1a2P43006 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc1a2P43006 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc1a2P43006 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc1a2P43006 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc1a2P43006 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc1a2P43006 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc1a2P43006 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc1a2P43006 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc1a2P43006 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc1a2P43006 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc1a2P43006 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc1a2P43006 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc1a2P43006 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc1a2P43006 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc1a2P43006 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc1a2P43006 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc1a2P43006 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc1a2P43006 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc1a2P43006 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc1a2P43006 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc1a2P43006 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc1a2P43006 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc1a2P43006 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc1a2P43006 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc1a2P43006 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc1a2P43006 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc1a2P43006 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc1a2P43006 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Slc1a2P43006 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc1a2P43006 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc1a2P43006 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc1a2P43006 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc1a2P43006 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc1a2P43006 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc1a2P43006 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc1a2P43006 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc1a2P43006 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc1a2P43006 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc1a2P43006 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc1a2P43006 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc1a2P43006 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc1a2P43006 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc1a2P43006 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc1a2P43006 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc1a2P43006 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc1a2P43006 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc1a2P43006 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc1a2P43006 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc1a2P43006 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc1a2P43006 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc1a2P43006 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc1a2P43006 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc1a2P43006 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc1a2P43006 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc1a2P43006 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc1a2P43006 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc1a2P43006 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc1a2P43006 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc1a2P43006 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc1a2P43006 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc1a2P43006 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc1a2P43006 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc1a2P43006 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc1a2P43006 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc1a2P43006 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc1a2P43006 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc1a2P43006 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc1a2P43006 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc1a2P43006 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc1a2P43006 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc1a2P43006 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc1a2P43006 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc1a2P43006 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc1a2P43006 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Slc1a2P43006 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc1a2P43006 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc1a2P43006 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 208.7 ms