Protein–RNA interactions for Protein: P40694

Ighmbp2, DNA-binding protein SMUBP-2, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighmbp2P40694 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ighmbp2P40694 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ighmbp2P40694 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ighmbp2P40694 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ighmbp2P40694 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ighmbp2P40694 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ighmbp2P40694 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ighmbp2P40694 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ighmbp2P40694 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ighmbp2P40694 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ighmbp2P40694 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ighmbp2P40694 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ighmbp2P40694 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ighmbp2P40694 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ighmbp2P40694 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ighmbp2P40694 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ighmbp2P40694 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ighmbp2P40694 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ighmbp2P40694 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ighmbp2P40694 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ighmbp2P40694 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ighmbp2P40694 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ighmbp2P40694 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ighmbp2P40694 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ighmbp2P40694 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ighmbp2P40694 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ighmbp2P40694 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ighmbp2P40694 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ighmbp2P40694 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ighmbp2P40694 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ighmbp2P40694 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ighmbp2P40694 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ighmbp2P40694 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ighmbp2P40694 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ighmbp2P40694 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ighmbp2P40694 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ighmbp2P40694 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ighmbp2P40694 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ighmbp2P40694 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ighmbp2P40694 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ighmbp2P40694 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ighmbp2P40694 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ighmbp2P40694 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ighmbp2P40694 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ighmbp2P40694 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ighmbp2P40694 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ighmbp2P40694 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ighmbp2P40694 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ighmbp2P40694 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ighmbp2P40694 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ighmbp2P40694 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ighmbp2P40694 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ighmbp2P40694 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ighmbp2P40694 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ighmbp2P40694 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ighmbp2P40694 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ighmbp2P40694 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ighmbp2P40694 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ighmbp2P40694 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ighmbp2P40694 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ighmbp2P40694 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ighmbp2P40694 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ighmbp2P40694 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ighmbp2P40694 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ighmbp2P40694 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ighmbp2P40694 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ighmbp2P40694 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ighmbp2P40694 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ighmbp2P40694 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ighmbp2P40694 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ighmbp2P40694 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ighmbp2P40694 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ighmbp2P40694 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ighmbp2P40694 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ighmbp2P40694 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ighmbp2P40694 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ighmbp2P40694 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ighmbp2P40694 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ighmbp2P40694 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ighmbp2P40694 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ighmbp2P40694 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ighmbp2P40694 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ighmbp2P40694 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ighmbp2P40694 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ighmbp2P40694 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ighmbp2P40694 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ighmbp2P40694 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ighmbp2P40694 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ighmbp2P40694 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ighmbp2P40694 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ighmbp2P40694 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ighmbp2P40694 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ighmbp2P40694 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ighmbp2P40694 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ighmbp2P40694 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ighmbp2P40694 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ighmbp2P40694 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ighmbp2P40694 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ighmbp2P40694 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ighmbp2P40694 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms