Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps26aP40336 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps26aP40336 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps26aP40336 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps26aP40336 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps26aP40336 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps26aP40336 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps26aP40336 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vps26aP40336 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps26aP40336 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps26aP40336 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps26aP40336 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps26aP40336 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps26aP40336 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps26aP40336 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps26aP40336 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps26aP40336 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps26aP40336 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps26aP40336 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps26aP40336 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps26aP40336 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps26aP40336 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps26aP40336 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps26aP40336 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps26aP40336 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps26aP40336 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps26aP40336 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps26aP40336 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps26aP40336 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps26aP40336 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps26aP40336 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps26aP40336 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps26aP40336 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vps26aP40336 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vps26aP40336 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vps26aP40336 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps26aP40336 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps26aP40336 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps26aP40336 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps26aP40336 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps26aP40336 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps26aP40336 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps26aP40336 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps26aP40336 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps26aP40336 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps26aP40336 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps26aP40336 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps26aP40336 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps26aP40336 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps26aP40336 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps26aP40336 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps26aP40336 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps26aP40336 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps26aP40336 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps26aP40336 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps26aP40336 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps26aP40336 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps26aP40336 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps26aP40336 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps26aP40336 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps26aP40336 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps26aP40336 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps26aP40336 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps26aP40336 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps26aP40336 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps26aP40336 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps26aP40336 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps26aP40336 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps26aP40336 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps26aP40336 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps26aP40336 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps26aP40336 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps26aP40336 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps26aP40336 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps26aP40336 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps26aP40336 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps26aP40336 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps26aP40336 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps26aP40336 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Vps26aP40336 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Vps26aP40336 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps26aP40336 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps26aP40336 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps26aP40336 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps26aP40336 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps26aP40336 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps26aP40336 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps26aP40336 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps26aP40336 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps26aP40336 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps26aP40336 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps26aP40336 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps26aP40336 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps26aP40336 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps26aP40336 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps26aP40336 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps26aP40336 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps26aP40336 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps26aP40336 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps26aP40336 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms