Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ThpoP40226 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ThpoP40226 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ThpoP40226 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ThpoP40226 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ThpoP40226 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ThpoP40226 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ThpoP40226 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ThpoP40226 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ThpoP40226 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ThpoP40226 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ThpoP40226 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ThpoP40226 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ThpoP40226 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ThpoP40226 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ThpoP40226 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ThpoP40226 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ThpoP40226 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ThpoP40226 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ThpoP40226 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ThpoP40226 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ThpoP40226 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ThpoP40226 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ThpoP40226 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ThpoP40226 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ThpoP40226 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ThpoP40226 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ThpoP40226 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ThpoP40226 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ThpoP40226 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ThpoP40226 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ThpoP40226 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ThpoP40226 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ThpoP40226 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ThpoP40226 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ThpoP40226 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ThpoP40226 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ThpoP40226 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ThpoP40226 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ThpoP40226 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ThpoP40226 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ThpoP40226 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ThpoP40226 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ThpoP40226 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ThpoP40226 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ThpoP40226 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ThpoP40226 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ThpoP40226 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ThpoP40226 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ThpoP40226 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ThpoP40226 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ThpoP40226 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ThpoP40226 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ThpoP40226 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ThpoP40226 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ThpoP40226 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ThpoP40226 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ThpoP40226 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ThpoP40226 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ThpoP40226 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ThpoP40226 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ThpoP40226 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ThpoP40226 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ThpoP40226 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ThpoP40226 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ThpoP40226 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ThpoP40226 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ThpoP40226 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ThpoP40226 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ThpoP40226 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ThpoP40226 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ThpoP40226 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ThpoP40226 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ThpoP40226 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ThpoP40226 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ThpoP40226 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ThpoP40226 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ThpoP40226 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ThpoP40226 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ThpoP40226 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ThpoP40226 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ThpoP40226 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ThpoP40226 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ThpoP40226 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ThpoP40226 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ThpoP40226 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ThpoP40226 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ThpoP40226 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ThpoP40226 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ThpoP40226 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ThpoP40226 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ThpoP40226 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ThpoP40226 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ThpoP40226 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ThpoP40226 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ThpoP40226 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ThpoP40226 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ThpoP40226 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ThpoP40226 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ThpoP40226 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms