Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hoxc10P31257 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hoxc10P31257 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hoxc10P31257 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hoxc10P31257 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hoxc10P31257 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hoxc10P31257 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hoxc10P31257 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hoxc10P31257 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hoxc10P31257 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Hoxc10P31257 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Hoxc10P31257 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hoxc10P31257 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hoxc10P31257 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hoxc10P31257 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hoxc10P31257 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hoxc10P31257 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hoxc10P31257 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hoxc10P31257 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hoxc10P31257 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hoxc10P31257 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hoxc10P31257 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hoxc10P31257 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hoxc10P31257 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hoxc10P31257 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hoxc10P31257 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hoxc10P31257 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hoxc10P31257 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hoxc10P31257 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hoxc10P31257 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Hoxc10P31257 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hoxc10P31257 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxc10P31257 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxc10P31257 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxc10P31257 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hoxc10P31257 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Hoxc10P31257 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hoxc10P31257 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hoxc10P31257 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hoxc10P31257 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Hoxc10P31257 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Hoxc10P31257 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hoxc10P31257 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hoxc10P31257 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hoxc10P31257 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hoxc10P31257 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hoxc10P31257 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hoxc10P31257 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hoxc10P31257 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hoxc10P31257 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hoxc10P31257 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hoxc10P31257 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hoxc10P31257 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hoxc10P31257 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hoxc10P31257 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hoxc10P31257 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hoxc10P31257 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Hoxc10P31257 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hoxc10P31257 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hoxc10P31257 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hoxc10P31257 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Hoxc10P31257 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hoxc10P31257 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hoxc10P31257 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hoxc10P31257 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hoxc10P31257 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hoxc10P31257 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hoxc10P31257 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hoxc10P31257 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hoxc10P31257 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hoxc10P31257 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hoxc10P31257 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hoxc10P31257 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hoxc10P31257 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hoxc10P31257 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hoxc10P31257 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hoxc10P31257 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hoxc10P31257 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hoxc10P31257 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxc10P31257 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hoxc10P31257 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hoxc10P31257 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxc10P31257 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxc10P31257 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxc10P31257 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxc10P31257 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxc10P31257 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxc10P31257 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxc10P31257 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxc10P31257 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxc10P31257 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxc10P31257 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hoxc10P31257 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hoxc10P31257 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Hoxc10P31257 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hoxc10P31257 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hoxc10P31257 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hoxc10P31257 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hoxc10P31257 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hoxc10P31257 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms