Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VtnP29788 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
VtnP29788 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VtnP29788 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VtnP29788 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VtnP29788 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VtnP29788 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VtnP29788 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VtnP29788 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VtnP29788 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VtnP29788 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VtnP29788 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VtnP29788 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VtnP29788 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
VtnP29788 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VtnP29788 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
VtnP29788 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VtnP29788 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VtnP29788 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VtnP29788 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VtnP29788 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VtnP29788 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VtnP29788 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VtnP29788 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VtnP29788 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VtnP29788 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VtnP29788 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
VtnP29788 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VtnP29788 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VtnP29788 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VtnP29788 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VtnP29788 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VtnP29788 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VtnP29788 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VtnP29788 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VtnP29788 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VtnP29788 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VtnP29788 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VtnP29788 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VtnP29788 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VtnP29788 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VtnP29788 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VtnP29788 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VtnP29788 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
VtnP29788 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
VtnP29788 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VtnP29788 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VtnP29788 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VtnP29788 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
VtnP29788 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VtnP29788 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VtnP29788 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VtnP29788 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VtnP29788 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VtnP29788 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
VtnP29788 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VtnP29788 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VtnP29788 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VtnP29788 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VtnP29788 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VtnP29788 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VtnP29788 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VtnP29788 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
VtnP29788 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VtnP29788 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VtnP29788 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VtnP29788 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VtnP29788 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VtnP29788 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VtnP29788 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VtnP29788 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VtnP29788 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VtnP29788 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VtnP29788 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VtnP29788 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VtnP29788 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VtnP29788 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VtnP29788 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VtnP29788 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
VtnP29788 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VtnP29788 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
VtnP29788 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VtnP29788 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VtnP29788 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
VtnP29788 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VtnP29788 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VtnP29788 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VtnP29788 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VtnP29788 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VtnP29788 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VtnP29788 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VtnP29788 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VtnP29788 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VtnP29788 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VtnP29788 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VtnP29788 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VtnP29788 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VtnP29788 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
VtnP29788 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VtnP29788 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms