Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Casp1P29452 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Casp1P29452 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Casp1P29452 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Casp1P29452 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Casp1P29452 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Casp1P29452 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Casp1P29452 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Casp1P29452 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Casp1P29452 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Casp1P29452 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Casp1P29452 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Casp1P29452 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Casp1P29452 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Casp1P29452 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Casp1P29452 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Casp1P29452 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Casp1P29452 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Casp1P29452 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Casp1P29452 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Casp1P29452 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Casp1P29452 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Casp1P29452 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Casp1P29452 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Casp1P29452 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Casp1P29452 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Casp1P29452 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Casp1P29452 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Casp1P29452 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Casp1P29452 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Casp1P29452 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Casp1P29452 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Casp1P29452 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Casp1P29452 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Casp1P29452 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Casp1P29452 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Casp1P29452 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Casp1P29452 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Casp1P29452 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Casp1P29452 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Casp1P29452 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Casp1P29452 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Casp1P29452 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Casp1P29452 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Casp1P29452 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Casp1P29452 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Casp1P29452 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Casp1P29452 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Casp1P29452 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Casp1P29452 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Casp1P29452 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Casp1P29452 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Casp1P29452 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Casp1P29452 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Casp1P29452 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Casp1P29452 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Casp1P29452 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Casp1P29452 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Casp1P29452 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Casp1P29452 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Casp1P29452 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Casp1P29452 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Casp1P29452 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Casp1P29452 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Casp1P29452 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Casp1P29452 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Casp1P29452 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Casp1P29452 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Casp1P29452 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Casp1P29452 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Casp1P29452 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Casp1P29452 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Casp1P29452 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Casp1P29452 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Casp1P29452 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Casp1P29452 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Casp1P29452 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Casp1P29452 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Casp1P29452 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Casp1P29452 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Casp1P29452 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Casp1P29452 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Casp1P29452 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Casp1P29452 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Casp1P29452 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Casp1P29452 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Casp1P29452 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Casp1P29452 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Casp1P29452 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Casp1P29452 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Casp1P29452 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Casp1P29452 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Casp1P29452 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Casp1P29452 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Casp1P29452 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Casp1P29452 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Casp1P29452 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Casp1P29452 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Casp1P29452 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Casp1P29452 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.5 ms