Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lef1P27782 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lef1P27782 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lef1P27782 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lef1P27782 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lef1P27782 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lef1P27782 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lef1P27782 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lef1P27782 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lef1P27782 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lef1P27782 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lef1P27782 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lef1P27782 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lef1P27782 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lef1P27782 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lef1P27782 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lef1P27782 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lef1P27782 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lef1P27782 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lef1P27782 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lef1P27782 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lef1P27782 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lef1P27782 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lef1P27782 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lef1P27782 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lef1P27782 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lef1P27782 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lef1P27782 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lef1P27782 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lef1P27782 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lef1P27782 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lef1P27782 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lef1P27782 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lef1P27782 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lef1P27782 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lef1P27782 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lef1P27782 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lef1P27782 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lef1P27782 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lef1P27782 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lef1P27782 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lef1P27782 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lef1P27782 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lef1P27782 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lef1P27782 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lef1P27782 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lef1P27782 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lef1P27782 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lef1P27782 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lef1P27782 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lef1P27782 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lef1P27782 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lef1P27782 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lef1P27782 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lef1P27782 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Lef1P27782 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Lef1P27782 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lef1P27782 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lef1P27782 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lef1P27782 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lef1P27782 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lef1P27782 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lef1P27782 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lef1P27782 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lef1P27782 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Lef1P27782 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lef1P27782 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lef1P27782 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lef1P27782 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lef1P27782 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lef1P27782 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lef1P27782 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lef1P27782 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lef1P27782 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lef1P27782 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lef1P27782 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lef1P27782 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lef1P27782 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lef1P27782 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lef1P27782 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lef1P27782 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Lef1P27782 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lef1P27782 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lef1P27782 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lef1P27782 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lef1P27782 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lef1P27782 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lef1P27782 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lef1P27782 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lef1P27782 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lef1P27782 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Lef1P27782 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lef1P27782 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Lef1P27782 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lef1P27782 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lef1P27782 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lef1P27782 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lef1P27782 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lef1P27782 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lef1P27782 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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