Protein–RNA interactions for Protein: P22907

Hmbs, Porphobilinogen deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmbsP22907 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HmbsP22907 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HmbsP22907 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HmbsP22907 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HmbsP22907 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HmbsP22907 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HmbsP22907 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HmbsP22907 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HmbsP22907 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HmbsP22907 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HmbsP22907 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HmbsP22907 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HmbsP22907 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HmbsP22907 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HmbsP22907 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HmbsP22907 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HmbsP22907 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HmbsP22907 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HmbsP22907 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HmbsP22907 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HmbsP22907 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HmbsP22907 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HmbsP22907 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HmbsP22907 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HmbsP22907 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HmbsP22907 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HmbsP22907 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HmbsP22907 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HmbsP22907 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HmbsP22907 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HmbsP22907 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HmbsP22907 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HmbsP22907 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HmbsP22907 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HmbsP22907 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HmbsP22907 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HmbsP22907 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HmbsP22907 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HmbsP22907 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HmbsP22907 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HmbsP22907 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HmbsP22907 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HmbsP22907 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HmbsP22907 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HmbsP22907 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HmbsP22907 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HmbsP22907 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HmbsP22907 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HmbsP22907 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HmbsP22907 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HmbsP22907 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HmbsP22907 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HmbsP22907 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HmbsP22907 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HmbsP22907 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HmbsP22907 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HmbsP22907 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HmbsP22907 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HmbsP22907 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HmbsP22907 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HmbsP22907 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HmbsP22907 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HmbsP22907 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HmbsP22907 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HmbsP22907 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HmbsP22907 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HmbsP22907 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HmbsP22907 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HmbsP22907 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HmbsP22907 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HmbsP22907 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HmbsP22907 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HmbsP22907 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HmbsP22907 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HmbsP22907 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HmbsP22907 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HmbsP22907 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HmbsP22907 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HmbsP22907 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HmbsP22907 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HmbsP22907 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HmbsP22907 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HmbsP22907 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HmbsP22907 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HmbsP22907 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HmbsP22907 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HmbsP22907 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HmbsP22907 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HmbsP22907 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HmbsP22907 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HmbsP22907 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HmbsP22907 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HmbsP22907 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HmbsP22907 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HmbsP22907 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HmbsP22907 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HmbsP22907 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HmbsP22907 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HmbsP22907 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HmbsP22907 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms