Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxb9P20615 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxb9P20615 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxb9P20615 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxb9P20615 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxb9P20615 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb9P20615 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb9P20615 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb9P20615 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb9P20615 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb9P20615 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb9P20615 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb9P20615 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxb9P20615 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxb9P20615 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxb9P20615 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxb9P20615 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxb9P20615 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxb9P20615 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxb9P20615 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxb9P20615 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxb9P20615 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxb9P20615 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxb9P20615 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxb9P20615 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxb9P20615 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxb9P20615 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxb9P20615 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxb9P20615 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxb9P20615 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxb9P20615 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxb9P20615 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxb9P20615 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxb9P20615 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxb9P20615 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxb9P20615 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxb9P20615 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxb9P20615 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxb9P20615 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxb9P20615 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxb9P20615 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxb9P20615 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hoxb9P20615 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxb9P20615 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxb9P20615 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxb9P20615 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxb9P20615 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxb9P20615 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxb9P20615 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxb9P20615 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxb9P20615 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxb9P20615 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxb9P20615 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxb9P20615 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb9P20615 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb9P20615 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb9P20615 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb9P20615 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb9P20615 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxb9P20615 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hoxb9P20615 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxb9P20615 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxb9P20615 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxb9P20615 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxb9P20615 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxb9P20615 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxb9P20615 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxb9P20615 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxb9P20615 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxb9P20615 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxb9P20615 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxb9P20615 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxb9P20615 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxb9P20615 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxb9P20615 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxb9P20615 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxb9P20615 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxb9P20615 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxb9P20615 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxb9P20615 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxb9P20615 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxb9P20615 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxb9P20615 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxb9P20615 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxb9P20615 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxb9P20615 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxb9P20615 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxb9P20615 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxb9P20615 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxb9P20615 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxb9P20615 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxb9P20615 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxb9P20615 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxb9P20615 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxb9P20615 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxb9P20615 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxb9P20615 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxb9P20615 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxb9P20615 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxb9P20615 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms