Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtpraP18052 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtpraP18052 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtpraP18052 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PtpraP18052 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtpraP18052 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtpraP18052 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtpraP18052 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PtpraP18052 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PtpraP18052 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtpraP18052 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtpraP18052 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtpraP18052 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtpraP18052 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtpraP18052 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtpraP18052 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PtpraP18052 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PtpraP18052 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtpraP18052 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtpraP18052 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtpraP18052 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtpraP18052 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtpraP18052 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtpraP18052 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtpraP18052 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtpraP18052 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PtpraP18052 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtpraP18052 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtpraP18052 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtpraP18052 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtpraP18052 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtpraP18052 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PtpraP18052 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PtpraP18052 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PtpraP18052 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PtpraP18052 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtpraP18052 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtpraP18052 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtpraP18052 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtpraP18052 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtpraP18052 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtpraP18052 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtpraP18052 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtpraP18052 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PtpraP18052 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PtpraP18052 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PtpraP18052 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PtpraP18052 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PtpraP18052 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PtpraP18052 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PtpraP18052 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PtpraP18052 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PtpraP18052 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtpraP18052 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtpraP18052 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtpraP18052 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtpraP18052 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtpraP18052 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtpraP18052 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtpraP18052 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtpraP18052 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtpraP18052 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtpraP18052 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtpraP18052 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtpraP18052 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PtpraP18052 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtpraP18052 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtpraP18052 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtpraP18052 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PtpraP18052 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PtpraP18052 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PtpraP18052 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtpraP18052 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtpraP18052 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtpraP18052 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtpraP18052 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtpraP18052 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtpraP18052 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtpraP18052 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtpraP18052 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtpraP18052 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtpraP18052 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtpraP18052 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtpraP18052 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtpraP18052 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtpraP18052 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtpraP18052 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtpraP18052 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtpraP18052 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtpraP18052 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtpraP18052 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtpraP18052 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtpraP18052 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtpraP18052 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtpraP18052 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtpraP18052 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtpraP18052 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PtpraP18052 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtpraP18052 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtpraP18052 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.2 ms