Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata1P17679 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata1P17679 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata1P17679 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata1P17679 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata1P17679 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata1P17679 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata1P17679 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata1P17679 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata1P17679 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata1P17679 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata1P17679 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata1P17679 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata1P17679 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata1P17679 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata1P17679 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata1P17679 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata1P17679 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata1P17679 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata1P17679 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata1P17679 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata1P17679 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata1P17679 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata1P17679 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata1P17679 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata1P17679 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata1P17679 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata1P17679 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata1P17679 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata1P17679 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata1P17679 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gata1P17679 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gata1P17679 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gata1P17679 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gata1P17679 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gata1P17679 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata1P17679 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata1P17679 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata1P17679 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata1P17679 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata1P17679 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata1P17679 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata1P17679 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata1P17679 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata1P17679 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata1P17679 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata1P17679 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gata1P17679 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gata1P17679 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gata1P17679 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gata1P17679 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gata1P17679 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gata1P17679 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gata1P17679 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gata1P17679 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gata1P17679 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gata1P17679 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gata1P17679 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gata1P17679 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gata1P17679 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gata1P17679 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gata1P17679 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gata1P17679 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gata1P17679 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gata1P17679 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gata1P17679 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gata1P17679 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gata1P17679 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gata1P17679 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gata1P17679 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gata1P17679 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gata1P17679 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gata1P17679 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata1P17679 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata1P17679 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata1P17679 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata1P17679 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata1P17679 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata1P17679 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata1P17679 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata1P17679 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata1P17679 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata1P17679 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata1P17679 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata1P17679 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata1P17679 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata1P17679 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata1P17679 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata1P17679 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata1P17679 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gata1P17679 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gata1P17679 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gata1P17679 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gata1P17679 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gata1P17679 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gata1P17679 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gata1P17679 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gata1P17679 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gata1P17679 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata1P17679 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms