Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sptan1P16546 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sptan1P16546 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sptan1P16546 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sptan1P16546 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sptan1P16546 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sptan1P16546 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sptan1P16546 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sptan1P16546 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sptan1P16546 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sptan1P16546 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sptan1P16546 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sptan1P16546 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sptan1P16546 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sptan1P16546 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sptan1P16546 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sptan1P16546 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sptan1P16546 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sptan1P16546 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sptan1P16546 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sptan1P16546 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sptan1P16546 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sptan1P16546 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sptan1P16546 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sptan1P16546 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sptan1P16546 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sptan1P16546 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sptan1P16546 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sptan1P16546 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sptan1P16546 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sptan1P16546 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sptan1P16546 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sptan1P16546 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sptan1P16546 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sptan1P16546 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sptan1P16546 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sptan1P16546 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sptan1P16546 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sptan1P16546 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sptan1P16546 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sptan1P16546 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sptan1P16546 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sptan1P16546 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sptan1P16546 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sptan1P16546 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sptan1P16546 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sptan1P16546 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sptan1P16546 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Sptan1P16546 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sptan1P16546 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sptan1P16546 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sptan1P16546 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sptan1P16546 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sptan1P16546 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sptan1P16546 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sptan1P16546 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sptan1P16546 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sptan1P16546 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sptan1P16546 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sptan1P16546 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sptan1P16546 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sptan1P16546 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sptan1P16546 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sptan1P16546 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sptan1P16546 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sptan1P16546 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sptan1P16546 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sptan1P16546 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sptan1P16546 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sptan1P16546 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sptan1P16546 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sptan1P16546 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sptan1P16546 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sptan1P16546 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sptan1P16546 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sptan1P16546 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sptan1P16546 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sptan1P16546 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Sptan1P16546 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sptan1P16546 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Sptan1P16546 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sptan1P16546 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sptan1P16546 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sptan1P16546 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sptan1P16546 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sptan1P16546 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sptan1P16546 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sptan1P16546 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Sptan1P16546 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sptan1P16546 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Sptan1P16546 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sptan1P16546 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sptan1P16546 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sptan1P16546 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sptan1P16546 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sptan1P16546 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sptan1P16546 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sptan1P16546 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sptan1P16546 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sptan1P16546 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms