Protein–RNA interactions for Protein: P11835

Itgb2, Integrin beta-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb2P11835 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb2P11835 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb2P11835 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb2P11835 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb2P11835 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb2P11835 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb2P11835 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb2P11835 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb2P11835 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb2P11835 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb2P11835 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb2P11835 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb2P11835 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb2P11835 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb2P11835 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb2P11835 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Itgb2P11835 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Itgb2P11835 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Itgb2P11835 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb2P11835 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb2P11835 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb2P11835 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb2P11835 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb2P11835 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb2P11835 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb2P11835 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb2P11835 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb2P11835 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb2P11835 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb2P11835 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb2P11835 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb2P11835 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb2P11835 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb2P11835 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb2P11835 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb2P11835 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb2P11835 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb2P11835 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb2P11835 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb2P11835 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Itgb2P11835 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itgb2P11835 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Itgb2P11835 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb2P11835 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb2P11835 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb2P11835 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb2P11835 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb2P11835 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itgb2P11835 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb2P11835 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb2P11835 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb2P11835 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb2P11835 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb2P11835 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itgb2P11835 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itgb2P11835 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itgb2P11835 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Itgb2P11835 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itgb2P11835 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itgb2P11835 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itgb2P11835 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itgb2P11835 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itgb2P11835 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itgb2P11835 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itgb2P11835 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itgb2P11835 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itgb2P11835 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itgb2P11835 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itgb2P11835 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itgb2P11835 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itgb2P11835 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itgb2P11835 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itgb2P11835 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itgb2P11835 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itgb2P11835 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itgb2P11835 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itgb2P11835 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itgb2P11835 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itgb2P11835 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itgb2P11835 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itgb2P11835 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itgb2P11835 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itgb2P11835 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itgb2P11835 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itgb2P11835 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Itgb2P11835 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itgb2P11835 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itgb2P11835 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itgb2P11835 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itgb2P11835 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itgb2P11835 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itgb2P11835 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itgb2P11835 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itgb2P11835 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itgb2P11835 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itgb2P11835 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itgb2P11835 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itgb2P11835 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itgb2P11835 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itgb2P11835 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms