Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PolP10400 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PolP10400 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PolP10400 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PolP10400 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PolP10400 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PolP10400 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PolP10400 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PolP10400 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PolP10400 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PolP10400 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PolP10400 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PolP10400 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PolP10400 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PolP10400 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PolP10400 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PolP10400 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PolP10400 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PolP10400 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PolP10400 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PolP10400 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PolP10400 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PolP10400 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PolP10400 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PolP10400 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PolP10400 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolP10400 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolP10400 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolP10400 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolP10400 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolP10400 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolP10400 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolP10400 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolP10400 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PolP10400 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PolP10400 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PolP10400 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PolP10400 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PolP10400 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PolP10400 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PolP10400 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PolP10400 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PolP10400 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PolP10400 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PolP10400 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PolP10400 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PolP10400 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PolP10400 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PolP10400 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PolP10400 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PolP10400 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PolP10400 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PolP10400 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PolP10400 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PolP10400 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PolP10400 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PolP10400 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PolP10400 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PolP10400 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PolP10400 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PolP10400 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolP10400 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolP10400 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolP10400 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolP10400 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PolP10400 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolP10400 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolP10400 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolP10400 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolP10400 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolP10400 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolP10400 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolP10400 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolP10400 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolP10400 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PolP10400 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolP10400 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolP10400 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolP10400 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolP10400 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolP10400 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolP10400 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolP10400 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolP10400 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolP10400 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolP10400 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolP10400 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolP10400 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolP10400 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolP10400 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolP10400 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolP10400 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolP10400 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolP10400 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PolP10400 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PolP10400 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PolP10400 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PolP10400 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PolP10400 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PolP10400 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.2 ms