Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Schip1P0DPB4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Schip1P0DPB4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Schip1P0DPB4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Schip1P0DPB4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Schip1P0DPB4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Schip1P0DPB4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Schip1P0DPB4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Schip1P0DPB4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Schip1P0DPB4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Schip1P0DPB4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Schip1P0DPB4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Schip1P0DPB4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Schip1P0DPB4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Schip1P0DPB4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Schip1P0DPB4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Schip1P0DPB4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Schip1P0DPB4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Schip1P0DPB4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Schip1P0DPB4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Schip1P0DPB4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Schip1P0DPB4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Schip1P0DPB4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Schip1P0DPB4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Schip1P0DPB4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Schip1P0DPB4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Schip1P0DPB4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Schip1P0DPB4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Schip1P0DPB4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Schip1P0DPB4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Schip1P0DPB4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Schip1P0DPB4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Schip1P0DPB4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Schip1P0DPB4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Schip1P0DPB4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Schip1P0DPB4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Schip1P0DPB4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Schip1P0DPB4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Schip1P0DPB4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Schip1P0DPB4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Schip1P0DPB4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Schip1P0DPB4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Schip1P0DPB4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Schip1P0DPB4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Schip1P0DPB4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Schip1P0DPB4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Schip1P0DPB4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Schip1P0DPB4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Schip1P0DPB4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Schip1P0DPB4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Schip1P0DPB4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Schip1P0DPB4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Schip1P0DPB4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Schip1P0DPB4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Schip1P0DPB4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Schip1P0DPB4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Schip1P0DPB4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Schip1P0DPB4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Schip1P0DPB4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Schip1P0DPB4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Schip1P0DPB4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Schip1P0DPB4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Schip1P0DPB4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Schip1P0DPB4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Schip1P0DPB4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Schip1P0DPB4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Schip1P0DPB4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Schip1P0DPB4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Schip1P0DPB4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Schip1P0DPB4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Schip1P0DPB4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Schip1P0DPB4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Schip1P0DPB4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Schip1P0DPB4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Schip1P0DPB4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Schip1P0DPB4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Schip1P0DPB4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Schip1P0DPB4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Schip1P0DPB4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Schip1P0DPB4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Schip1P0DPB4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Schip1P0DPB4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Schip1P0DPB4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Schip1P0DPB4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Schip1P0DPB4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Schip1P0DPB4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Schip1P0DPB4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Schip1P0DPB4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Schip1P0DPB4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Schip1P0DPB4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Schip1P0DPB4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Schip1P0DPB4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Schip1P0DPB4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Schip1P0DPB4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Schip1P0DPB4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Schip1P0DPB4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Schip1P0DPB4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Schip1P0DPB4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Schip1P0DPB4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Schip1P0DPB4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 623 ms