Protein–RNA interactions for Protein: P08730

Krt13, Keratin, type I cytoskeletal 13, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt13P08730 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt13P08730 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt13P08730 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt13P08730 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt13P08730 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt13P08730 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt13P08730 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt13P08730 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt13P08730 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt13P08730 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt13P08730 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt13P08730 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt13P08730 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt13P08730 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt13P08730 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Krt13P08730 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt13P08730 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt13P08730 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt13P08730 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt13P08730 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt13P08730 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt13P08730 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt13P08730 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt13P08730 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt13P08730 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt13P08730 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt13P08730 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt13P08730 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt13P08730 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt13P08730 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt13P08730 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt13P08730 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt13P08730 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt13P08730 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt13P08730 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt13P08730 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt13P08730 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt13P08730 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt13P08730 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt13P08730 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt13P08730 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt13P08730 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt13P08730 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt13P08730 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt13P08730 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt13P08730 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt13P08730 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt13P08730 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt13P08730 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt13P08730 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt13P08730 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt13P08730 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt13P08730 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt13P08730 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt13P08730 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt13P08730 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt13P08730 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt13P08730 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt13P08730 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt13P08730 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt13P08730 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt13P08730 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt13P08730 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt13P08730 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt13P08730 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt13P08730 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt13P08730 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt13P08730 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt13P08730 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt13P08730 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt13P08730 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt13P08730 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt13P08730 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt13P08730 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt13P08730 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt13P08730 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt13P08730 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt13P08730 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt13P08730 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt13P08730 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt13P08730 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt13P08730 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt13P08730 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt13P08730 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt13P08730 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt13P08730 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt13P08730 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt13P08730 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt13P08730 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt13P08730 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt13P08730 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt13P08730 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt13P08730 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt13P08730 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt13P08730 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt13P08730 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt13P08730 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt13P08730 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt13P08730 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt13P08730 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms