Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a2P08122 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a2P08122 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a2P08122 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a2P08122 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a2P08122 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a2P08122 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a2P08122 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a2P08122 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a2P08122 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a2P08122 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col4a2P08122 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col4a2P08122 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col4a2P08122 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col4a2P08122 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a2P08122 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col4a2P08122 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col4a2P08122 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Col4a2P08122 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col4a2P08122 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col4a2P08122 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a2P08122 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a2P08122 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a2P08122 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a2P08122 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a2P08122 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a2P08122 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a2P08122 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Col4a2P08122 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col4a2P08122 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col4a2P08122 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col4a2P08122 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col4a2P08122 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col4a2P08122 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col4a2P08122 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col4a2P08122 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col4a2P08122 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col4a2P08122 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col4a2P08122 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col4a2P08122 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col4a2P08122 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col4a2P08122 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Col4a2P08122 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col4a2P08122 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Col4a2P08122 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col4a2P08122 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col4a2P08122 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col4a2P08122 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col4a2P08122 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a2P08122 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a2P08122 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a2P08122 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col4a2P08122 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col4a2P08122 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col4a2P08122 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col4a2P08122 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Col4a2P08122 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col4a2P08122 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a2P08122 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a2P08122 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col4a2P08122 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Col4a2P08122 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col4a2P08122 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Col4a2P08122 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Col4a2P08122 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Col4a2P08122 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Col4a2P08122 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col4a2P08122 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a2P08122 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a2P08122 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a2P08122 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col4a2P08122 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col4a2P08122 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col4a2P08122 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col4a2P08122 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col4a2P08122 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col4a2P08122 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col4a2P08122 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col4a2P08122 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Col4a2P08122 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col4a2P08122 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a2P08122 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a2P08122 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a2P08122 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a2P08122 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a2P08122 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a2P08122 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a2P08122 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col4a2P08122 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col4a2P08122 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Col4a2P08122 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Col4a2P08122 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Col4a2P08122 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Col4a2P08122 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col4a2P08122 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col4a2P08122 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col4a2P08122 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col4a2P08122 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Col4a2P08122 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col4a2P08122 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.9 ms