Protein–RNA interactions for Protein: P07214

Sparc, SPARC, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SparcP07214 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SparcP07214 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SparcP07214 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SparcP07214 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SparcP07214 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SparcP07214 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SparcP07214 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SparcP07214 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SparcP07214 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SparcP07214 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SparcP07214 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SparcP07214 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SparcP07214 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SparcP07214 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SparcP07214 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SparcP07214 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SparcP07214 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SparcP07214 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SparcP07214 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SparcP07214 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SparcP07214 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SparcP07214 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SparcP07214 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SparcP07214 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SparcP07214 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SparcP07214 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SparcP07214 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SparcP07214 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SparcP07214 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SparcP07214 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SparcP07214 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SparcP07214 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SparcP07214 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SparcP07214 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SparcP07214 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SparcP07214 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SparcP07214 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SparcP07214 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SparcP07214 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SparcP07214 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SparcP07214 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SparcP07214 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SparcP07214 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SparcP07214 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SparcP07214 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SparcP07214 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SparcP07214 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SparcP07214 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SparcP07214 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SparcP07214 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SparcP07214 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SparcP07214 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SparcP07214 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SparcP07214 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SparcP07214 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SparcP07214 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SparcP07214 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SparcP07214 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SparcP07214 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SparcP07214 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SparcP07214 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SparcP07214 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SparcP07214 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SparcP07214 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SparcP07214 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SparcP07214 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SparcP07214 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SparcP07214 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SparcP07214 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SparcP07214 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SparcP07214 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SparcP07214 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SparcP07214 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SparcP07214 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SparcP07214 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SparcP07214 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SparcP07214 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SparcP07214 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SparcP07214 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SparcP07214 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SparcP07214 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SparcP07214 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SparcP07214 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SparcP07214 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SparcP07214 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SparcP07214 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SparcP07214 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SparcP07214 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SparcP07214 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SparcP07214 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SparcP07214 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SparcP07214 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SparcP07214 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SparcP07214 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SparcP07214 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SparcP07214 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SparcP07214 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SparcP07214 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SparcP07214 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SparcP07214 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms