Protein–RNA interactions for Protein: P06799

Ifna7, Interferon alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna7P06799 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ifna7P06799 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifna7P06799 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifna7P06799 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifna7P06799 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifna7P06799 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifna7P06799 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifna7P06799 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifna7P06799 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifna7P06799 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifna7P06799 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifna7P06799 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifna7P06799 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ifna7P06799 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ifna7P06799 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ifna7P06799 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ifna7P06799 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ifna7P06799 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ifna7P06799 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ifna7P06799 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ifna7P06799 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ifna7P06799 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ifna7P06799 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ifna7P06799 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ifna7P06799 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ifna7P06799 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ifna7P06799 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ifna7P06799 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ifna7P06799 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ifna7P06799 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ifna7P06799 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ifna7P06799 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ifna7P06799 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ifna7P06799 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ifna7P06799 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ifna7P06799 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ifna7P06799 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ifna7P06799 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ifna7P06799 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ifna7P06799 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ifna7P06799 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ifna7P06799 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ifna7P06799 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifna7P06799 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifna7P06799 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifna7P06799 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifna7P06799 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifna7P06799 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifna7P06799 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifna7P06799 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifna7P06799 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifna7P06799 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifna7P06799 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifna7P06799 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifna7P06799 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifna7P06799 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifna7P06799 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifna7P06799 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ifna7P06799 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ifna7P06799 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifna7P06799 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifna7P06799 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifna7P06799 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifna7P06799 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifna7P06799 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifna7P06799 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifna7P06799 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifna7P06799 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifna7P06799 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifna7P06799 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifna7P06799 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifna7P06799 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifna7P06799 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifna7P06799 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifna7P06799 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifna7P06799 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifna7P06799 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifna7P06799 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifna7P06799 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifna7P06799 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifna7P06799 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifna7P06799 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifna7P06799 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifna7P06799 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Ifna7P06799 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifna7P06799 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifna7P06799 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifna7P06799 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifna7P06799 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifna7P06799 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifna7P06799 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifna7P06799 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifna7P06799 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifna7P06799 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifna7P06799 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifna7P06799 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifna7P06799 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifna7P06799 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifna7P06799 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifna7P06799 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms