Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01679 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
P01679 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01679 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01679 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01679 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
P01679 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01679 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
P01679 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01679 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01679 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01679 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01679 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
P01679 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01679 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01679 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
P01679 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01679 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01679 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01679 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01679 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01679 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01679 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01679 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01679 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01679 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01679 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01679 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01679 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01679 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
P01679 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01679 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01679 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01679 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01679 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01679 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01679 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01679 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01679 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01679 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01679 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01679 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01679 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
P01679 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01679 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01679 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01679 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01679 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01679 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01679 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01679 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01679 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01679 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01679 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01679 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01679 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01679 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01679 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01679 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01679 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01679 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
P01679 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
P01679 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01679 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01679 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01679 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01679 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01679 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01679 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01679 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01679 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01679 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01679 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
P01679 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01679 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
P01679 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01679 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01679 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01679 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01679 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01679 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01679 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01679 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01679 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01679 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01679 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01679 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01679 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01679 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01679 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01679 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01679 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01679 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01679 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01679 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01679 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01679 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01679 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01679 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01679 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms