Protein–RNA interactions for Protein: P01669

Ig kappa chain V-III region PC 7769, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01669 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01669 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
P01669 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
P01669 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01669 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01669 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01669 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01669 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01669 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01669 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01669 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01669 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01669 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01669 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
P01669 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
P01669 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
P01669 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01669 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01669 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01669 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
P01669 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01669 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01669 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01669 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01669 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01669 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01669 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01669 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01669 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01669 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01669 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01669 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01669 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01669 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01669 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01669 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01669 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01669 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01669 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01669 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01669 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01669 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01669 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01669 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01669 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01669 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01669 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01669 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
P01669 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01669 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01669 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01669 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01669 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01669 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01669 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01669 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01669 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01669 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01669 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01669 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
P01669 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01669 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01669 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01669 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01669 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
P01669 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01669 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01669 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01669 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01669 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01669 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01669 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01669 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01669 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01669 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
P01669 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01669 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01669 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01669 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01669 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
P01669 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
P01669 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
P01669 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
P01669 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01669 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01669 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01669 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01669 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01669 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01669 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01669 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01669 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01669 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01669 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01669 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01669 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01669 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01669 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01669 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01669 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms