Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01641 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
P01641 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01641 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01641 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01641 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01641 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01641 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01641 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01641 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01641 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01641 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01641 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
P01641 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01641 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01641 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01641 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01641 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01641 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01641 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01641 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
P01641 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
P01641 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
P01641 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P01641 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P01641 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P01641 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
P01641 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
P01641 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
P01641 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P01641 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
P01641 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P01641 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
P01641 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
P01641 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P01641 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01641 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01641 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01641 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P01641 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
P01641 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P01641 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P01641 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01641 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
P01641 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
P01641 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
P01641 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
P01641 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
P01641 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01641 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P01641 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P01641 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P01641 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01641 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
P01641 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01641 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01641 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01641 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01641 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01641 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P01641 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
P01641 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
P01641 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P01641 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P01641 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P01641 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P01641 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01641 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01641 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01641 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01641 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P01641 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P01641 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P01641 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P01641 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P01641 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01641 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01641 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01641 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
P01641 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01641 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01641 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01641 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01641 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01641 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01641 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01641 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01641 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01641 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01641 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
P01641 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01641 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01641 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01641 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
P01641 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01641 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01641 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01641 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01641 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01641 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms