Protein–RNA interactions for Protein: O88978

Lrrc6, Protein tilB homolog, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc6O88978 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc6O88978 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc6O88978 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc6O88978 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc6O88978 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc6O88978 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc6O88978 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc6O88978 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc6O88978 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc6O88978 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lrrc6O88978 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc6O88978 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc6O88978 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc6O88978 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc6O88978 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc6O88978 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc6O88978 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc6O88978 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc6O88978 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc6O88978 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc6O88978 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc6O88978 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc6O88978 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc6O88978 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc6O88978 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc6O88978 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc6O88978 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc6O88978 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc6O88978 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc6O88978 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrrc6O88978 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrrc6O88978 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrc6O88978 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrc6O88978 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrc6O88978 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc6O88978 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc6O88978 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc6O88978 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc6O88978 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc6O88978 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc6O88978 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc6O88978 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc6O88978 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc6O88978 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc6O88978 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc6O88978 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc6O88978 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc6O88978 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc6O88978 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc6O88978 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc6O88978 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc6O88978 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc6O88978 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc6O88978 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc6O88978 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc6O88978 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc6O88978 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc6O88978 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc6O88978 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc6O88978 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc6O88978 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc6O88978 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc6O88978 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc6O88978 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc6O88978 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc6O88978 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc6O88978 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc6O88978 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc6O88978 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc6O88978 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc6O88978 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc6O88978 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc6O88978 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc6O88978 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc6O88978 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrc6O88978 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrc6O88978 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc6O88978 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc6O88978 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc6O88978 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc6O88978 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc6O88978 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc6O88978 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc6O88978 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrc6O88978 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrc6O88978 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrc6O88978 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrc6O88978 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc6O88978 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrc6O88978 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrc6O88978 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrc6O88978 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrc6O88978 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc6O88978 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc6O88978 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc6O88978 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc6O88978 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc6O88978 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrc6O88978 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrc6O88978 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms