Protein–RNA interactions for Protein: O88907

Pias1, E3 SUMO-protein ligase PIAS1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pias1O88907 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pias1O88907 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pias1O88907 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Pias1O88907 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pias1O88907 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pias1O88907 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pias1O88907 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pias1O88907 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pias1O88907 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pias1O88907 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pias1O88907 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pias1O88907 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pias1O88907 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pias1O88907 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pias1O88907 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pias1O88907 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pias1O88907 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pias1O88907 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pias1O88907 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pias1O88907 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pias1O88907 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pias1O88907 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pias1O88907 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pias1O88907 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pias1O88907 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pias1O88907 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pias1O88907 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pias1O88907 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pias1O88907 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pias1O88907 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pias1O88907 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pias1O88907 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pias1O88907 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pias1O88907 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pias1O88907 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pias1O88907 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pias1O88907 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pias1O88907 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pias1O88907 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pias1O88907 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pias1O88907 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pias1O88907 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pias1O88907 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pias1O88907 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pias1O88907 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pias1O88907 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pias1O88907 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pias1O88907 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pias1O88907 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pias1O88907 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pias1O88907 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pias1O88907 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pias1O88907 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pias1O88907 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pias1O88907 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pias1O88907 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pias1O88907 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pias1O88907 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pias1O88907 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pias1O88907 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Pias1O88907 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pias1O88907 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pias1O88907 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pias1O88907 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pias1O88907 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pias1O88907 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pias1O88907 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pias1O88907 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pias1O88907 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pias1O88907 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pias1O88907 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pias1O88907 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pias1O88907 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pias1O88907 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pias1O88907 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pias1O88907 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pias1O88907 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pias1O88907 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pias1O88907 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pias1O88907 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pias1O88907 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pias1O88907 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pias1O88907 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pias1O88907 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pias1O88907 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pias1O88907 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pias1O88907 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pias1O88907 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pias1O88907 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pias1O88907 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pias1O88907 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pias1O88907 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pias1O88907 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pias1O88907 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pias1O88907 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pias1O88907 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pias1O88907 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pias1O88907 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pias1O88907 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pias1O88907 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms