Protein–RNA interactions for Protein: O88708

Orc4, Origin recognition complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Orc4O88708 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Orc4O88708 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Orc4O88708 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Orc4O88708 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Orc4O88708 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Orc4O88708 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Orc4O88708 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Orc4O88708 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Orc4O88708 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Orc4O88708 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Orc4O88708 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Orc4O88708 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Orc4O88708 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Orc4O88708 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Orc4O88708 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Orc4O88708 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Orc4O88708 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Orc4O88708 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Orc4O88708 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Orc4O88708 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Orc4O88708 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Orc4O88708 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Orc4O88708 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Orc4O88708 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Orc4O88708 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Orc4O88708 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Orc4O88708 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Orc4O88708 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Orc4O88708 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Orc4O88708 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Orc4O88708 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Orc4O88708 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Orc4O88708 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Orc4O88708 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Orc4O88708 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Orc4O88708 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Orc4O88708 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Orc4O88708 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Orc4O88708 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Orc4O88708 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Orc4O88708 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Orc4O88708 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Orc4O88708 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Orc4O88708 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Orc4O88708 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Orc4O88708 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Orc4O88708 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Orc4O88708 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Orc4O88708 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Orc4O88708 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Orc4O88708 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Orc4O88708 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Orc4O88708 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Orc4O88708 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Orc4O88708 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Orc4O88708 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Orc4O88708 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Orc4O88708 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Orc4O88708 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Orc4O88708 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Orc4O88708 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Orc4O88708 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Orc4O88708 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Orc4O88708 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Orc4O88708 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Orc4O88708 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Orc4O88708 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Orc4O88708 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Orc4O88708 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Orc4O88708 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Orc4O88708 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Orc4O88708 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Orc4O88708 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Orc4O88708 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Orc4O88708 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Orc4O88708 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Orc4O88708 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Orc4O88708 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Orc4O88708 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Orc4O88708 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Orc4O88708 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Orc4O88708 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Orc4O88708 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Orc4O88708 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Orc4O88708 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Orc4O88708 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Orc4O88708 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Orc4O88708 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Orc4O88708 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Orc4O88708 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Orc4O88708 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Orc4O88708 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Orc4O88708 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Orc4O88708 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Orc4O88708 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Orc4O88708 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Orc4O88708 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Orc4O88708 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Orc4O88708 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Orc4O88708 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms