Protein–RNA interactions for Protein: O88573

Aff1, AF4/FMR2 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff1O88573 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Aff1O88573 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Aff1O88573 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Aff1O88573 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Aff1O88573 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Aff1O88573 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Aff1O88573 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Aff1O88573 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Aff1O88573 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Aff1O88573 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Aff1O88573 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Aff1O88573 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Aff1O88573 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Aff1O88573 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Aff1O88573 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Aff1O88573 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Aff1O88573 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Aff1O88573 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Aff1O88573 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Aff1O88573 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Aff1O88573 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Aff1O88573 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Aff1O88573 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Aff1O88573 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Aff1O88573 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Aff1O88573 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Aff1O88573 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Aff1O88573 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Aff1O88573 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Aff1O88573 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Aff1O88573 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Aff1O88573 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Aff1O88573 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Aff1O88573 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Aff1O88573 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Aff1O88573 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Aff1O88573 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Aff1O88573 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Aff1O88573 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Aff1O88573 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Aff1O88573 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Aff1O88573 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Aff1O88573 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Aff1O88573 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Aff1O88573 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Aff1O88573 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Aff1O88573 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Aff1O88573 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Aff1O88573 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Aff1O88573 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Aff1O88573 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Aff1O88573 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Aff1O88573 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Aff1O88573 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Aff1O88573 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Aff1O88573 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Aff1O88573 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Aff1O88573 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Aff1O88573 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Aff1O88573 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Aff1O88573 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Aff1O88573 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Aff1O88573 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Aff1O88573 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Aff1O88573 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Aff1O88573 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Aff1O88573 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Aff1O88573 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Aff1O88573 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Aff1O88573 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Aff1O88573 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Aff1O88573 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Aff1O88573 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Aff1O88573 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Aff1O88573 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Aff1O88573 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Aff1O88573 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Aff1O88573 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Aff1O88573 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Aff1O88573 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Aff1O88573 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Aff1O88573 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Aff1O88573 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Aff1O88573 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Aff1O88573 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Aff1O88573 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aff1O88573 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aff1O88573 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aff1O88573 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aff1O88573 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aff1O88573 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Aff1O88573 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Aff1O88573 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Aff1O88573 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Aff1O88573 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Aff1O88573 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Aff1O88573 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Aff1O88573 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Aff1O88573 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Aff1O88573 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms