Protein–RNA interactions for Protein: O88552

Cldn2, Claudin-2, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn2O88552 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cldn2O88552 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cldn2O88552 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cldn2O88552 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cldn2O88552 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cldn2O88552 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cldn2O88552 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cldn2O88552 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cldn2O88552 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cldn2O88552 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cldn2O88552 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cldn2O88552 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cldn2O88552 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cldn2O88552 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cldn2O88552 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cldn2O88552 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cldn2O88552 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cldn2O88552 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cldn2O88552 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cldn2O88552 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cldn2O88552 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cldn2O88552 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cldn2O88552 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cldn2O88552 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cldn2O88552 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cldn2O88552 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cldn2O88552 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cldn2O88552 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cldn2O88552 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cldn2O88552 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cldn2O88552 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cldn2O88552 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cldn2O88552 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cldn2O88552 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cldn2O88552 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cldn2O88552 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cldn2O88552 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cldn2O88552 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cldn2O88552 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cldn2O88552 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cldn2O88552 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cldn2O88552 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cldn2O88552 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cldn2O88552 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cldn2O88552 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cldn2O88552 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cldn2O88552 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cldn2O88552 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cldn2O88552 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cldn2O88552 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cldn2O88552 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cldn2O88552 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cldn2O88552 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cldn2O88552 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cldn2O88552 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cldn2O88552 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cldn2O88552 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cldn2O88552 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cldn2O88552 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cldn2O88552 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cldn2O88552 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cldn2O88552 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cldn2O88552 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cldn2O88552 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cldn2O88552 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cldn2O88552 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cldn2O88552 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cldn2O88552 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cldn2O88552 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cldn2O88552 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cldn2O88552 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cldn2O88552 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cldn2O88552 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cldn2O88552 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cldn2O88552 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cldn2O88552 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cldn2O88552 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cldn2O88552 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cldn2O88552 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cldn2O88552 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cldn2O88552 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cldn2O88552 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cldn2O88552 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cldn2O88552 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cldn2O88552 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cldn2O88552 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cldn2O88552 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cldn2O88552 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cldn2O88552 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cldn2O88552 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cldn2O88552 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cldn2O88552 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cldn2O88552 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cldn2O88552 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cldn2O88552 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cldn2O88552 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cldn2O88552 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cldn2O88552 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cldn2O88552 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cldn2O88552 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms