Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dll3O88516 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dll3O88516 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Dll3O88516 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dll3O88516 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dll3O88516 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dll3O88516 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dll3O88516 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dll3O88516 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dll3O88516 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dll3O88516 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dll3O88516 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dll3O88516 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dll3O88516 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Dll3O88516 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dll3O88516 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dll3O88516 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dll3O88516 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dll3O88516 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dll3O88516 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Dll3O88516 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dll3O88516 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dll3O88516 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dll3O88516 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dll3O88516 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dll3O88516 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dll3O88516 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dll3O88516 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dll3O88516 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dll3O88516 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dll3O88516 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dll3O88516 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Dll3O88516 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Dll3O88516 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dll3O88516 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dll3O88516 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dll3O88516 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dll3O88516 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Dll3O88516 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dll3O88516 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dll3O88516 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dll3O88516 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Dll3O88516 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dll3O88516 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dll3O88516 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dll3O88516 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dll3O88516 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dll3O88516 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dll3O88516 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dll3O88516 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dll3O88516 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dll3O88516 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dll3O88516 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dll3O88516 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dll3O88516 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dll3O88516 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dll3O88516 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dll3O88516 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dll3O88516 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dll3O88516 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dll3O88516 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Dll3O88516 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Dll3O88516 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Dll3O88516 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dll3O88516 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dll3O88516 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dll3O88516 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Dll3O88516 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dll3O88516 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dll3O88516 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dll3O88516 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dll3O88516 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dll3O88516 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dll3O88516 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dll3O88516 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dll3O88516 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dll3O88516 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dll3O88516 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dll3O88516 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dll3O88516 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dll3O88516 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dll3O88516 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dll3O88516 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dll3O88516 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dll3O88516 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dll3O88516 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dll3O88516 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Dll3O88516 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dll3O88516 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dll3O88516 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dll3O88516 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Dll3O88516 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Dll3O88516 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dll3O88516 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dll3O88516 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dll3O88516 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dll3O88516 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dll3O88516 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Dll3O88516 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dll3O88516 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms