Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnmt3bO88509 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnmt3bO88509 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnmt3bO88509 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnmt3bO88509 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnmt3bO88509 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnmt3bO88509 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnmt3bO88509 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnmt3bO88509 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnmt3bO88509 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnmt3bO88509 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnmt3bO88509 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnmt3bO88509 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnmt3bO88509 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnmt3bO88509 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnmt3bO88509 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnmt3bO88509 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnmt3bO88509 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnmt3bO88509 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnmt3bO88509 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnmt3bO88509 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnmt3bO88509 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnmt3bO88509 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnmt3bO88509 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnmt3bO88509 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnmt3bO88509 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnmt3bO88509 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnmt3bO88509 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnmt3bO88509 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnmt3bO88509 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnmt3bO88509 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnmt3bO88509 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnmt3bO88509 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnmt3bO88509 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnmt3bO88509 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnmt3bO88509 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnmt3bO88509 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnmt3bO88509 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnmt3bO88509 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnmt3bO88509 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnmt3bO88509 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnmt3bO88509 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnmt3bO88509 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnmt3bO88509 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnmt3bO88509 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnmt3bO88509 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnmt3bO88509 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnmt3bO88509 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnmt3bO88509 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnmt3bO88509 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnmt3bO88509 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnmt3bO88509 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnmt3bO88509 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnmt3bO88509 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dnmt3bO88509 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dnmt3bO88509 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dnmt3bO88509 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnmt3bO88509 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnmt3bO88509 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnmt3bO88509 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnmt3bO88509 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnmt3bO88509 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnmt3bO88509 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnmt3bO88509 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnmt3bO88509 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnmt3bO88509 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnmt3bO88509 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnmt3bO88509 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnmt3bO88509 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnmt3bO88509 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnmt3bO88509 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnmt3bO88509 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnmt3bO88509 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnmt3bO88509 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnmt3bO88509 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnmt3bO88509 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dnmt3bO88509 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnmt3bO88509 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnmt3bO88509 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnmt3bO88509 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnmt3bO88509 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnmt3bO88509 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnmt3bO88509 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dnmt3bO88509 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dnmt3bO88509 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dnmt3bO88509 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dnmt3bO88509 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnmt3bO88509 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnmt3bO88509 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnmt3bO88509 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnmt3bO88509 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dnmt3bO88509 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Dnmt3bO88509 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Dnmt3bO88509 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnmt3bO88509 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnmt3bO88509 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnmt3bO88509 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnmt3bO88509 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnmt3bO88509 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnmt3bO88509 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 390.5 ms