Protein–RNA interactions for Protein: O88338

Cdh16, Cadherin-16, mousemouse

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh16O88338 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh16O88338 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh16O88338 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh16O88338 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh16O88338 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh16O88338 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh16O88338 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh16O88338 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cdh16O88338 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh16O88338 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh16O88338 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh16O88338 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh16O88338 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh16O88338 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh16O88338 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh16O88338 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh16O88338 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh16O88338 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh16O88338 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh16O88338 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh16O88338 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh16O88338 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh16O88338 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh16O88338 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh16O88338 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh16O88338 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh16O88338 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh16O88338 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh16O88338 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh16O88338 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh16O88338 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdh16O88338 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdh16O88338 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdh16O88338 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdh16O88338 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh16O88338 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh16O88338 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh16O88338 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh16O88338 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh16O88338 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh16O88338 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh16O88338 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh16O88338 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh16O88338 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh16O88338 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh16O88338 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh16O88338 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh16O88338 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh16O88338 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh16O88338 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh16O88338 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh16O88338 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh16O88338 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh16O88338 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh16O88338 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh16O88338 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh16O88338 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh16O88338 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh16O88338 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh16O88338 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh16O88338 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh16O88338 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh16O88338 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh16O88338 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh16O88338 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh16O88338 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdh16O88338 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh16O88338 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh16O88338 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh16O88338 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh16O88338 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh16O88338 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh16O88338 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh16O88338 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh16O88338 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh16O88338 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh16O88338 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh16O88338 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh16O88338 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh16O88338 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh16O88338 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh16O88338 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh16O88338 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh16O88338 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh16O88338 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh16O88338 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh16O88338 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh16O88338 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cdh16O88338 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh16O88338 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh16O88338 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh16O88338 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh16O88338 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh16O88338 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh16O88338 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh16O88338 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh16O88338 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh16O88338 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh16O88338 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh16O88338 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms