Protein–RNA interactions for Protein: O70230

Znf143, Zinc finger protein 143, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf143O70230 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf143O70230 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf143O70230 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf143O70230 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf143O70230 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf143O70230 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf143O70230 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf143O70230 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf143O70230 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf143O70230 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf143O70230 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf143O70230 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf143O70230 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf143O70230 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf143O70230 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf143O70230 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf143O70230 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf143O70230 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf143O70230 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf143O70230 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf143O70230 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf143O70230 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf143O70230 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf143O70230 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf143O70230 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf143O70230 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf143O70230 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf143O70230 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf143O70230 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Znf143O70230 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf143O70230 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Znf143O70230 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Znf143O70230 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf143O70230 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf143O70230 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf143O70230 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf143O70230 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf143O70230 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf143O70230 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf143O70230 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf143O70230 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf143O70230 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf143O70230 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf143O70230 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf143O70230 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf143O70230 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf143O70230 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf143O70230 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf143O70230 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf143O70230 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf143O70230 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf143O70230 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf143O70230 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf143O70230 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf143O70230 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf143O70230 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf143O70230 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf143O70230 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf143O70230 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf143O70230 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf143O70230 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf143O70230 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf143O70230 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf143O70230 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf143O70230 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf143O70230 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf143O70230 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf143O70230 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf143O70230 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf143O70230 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf143O70230 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf143O70230 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf143O70230 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf143O70230 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf143O70230 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf143O70230 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf143O70230 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf143O70230 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Znf143O70230 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Znf143O70230 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Znf143O70230 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Znf143O70230 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf143O70230 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf143O70230 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf143O70230 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf143O70230 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf143O70230 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf143O70230 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf143O70230 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf143O70230 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf143O70230 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf143O70230 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf143O70230 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf143O70230 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf143O70230 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf143O70230 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf143O70230 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf143O70230 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf143O70230 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf143O70230 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms