Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna1bO55017 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna1bO55017 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna1bO55017 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna1bO55017 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna1bO55017 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna1bO55017 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna1bO55017 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cacna1bO55017 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cacna1bO55017 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cacna1bO55017 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna1bO55017 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna1bO55017 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna1bO55017 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna1bO55017 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna1bO55017 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna1bO55017 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna1bO55017 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna1bO55017 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna1bO55017 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna1bO55017 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna1bO55017 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna1bO55017 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna1bO55017 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna1bO55017 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna1bO55017 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna1bO55017 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna1bO55017 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna1bO55017 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna1bO55017 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna1bO55017 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna1bO55017 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacna1bO55017 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacna1bO55017 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacna1bO55017 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna1bO55017 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna1bO55017 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna1bO55017 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna1bO55017 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna1bO55017 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna1bO55017 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna1bO55017 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna1bO55017 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna1bO55017 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna1bO55017 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna1bO55017 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna1bO55017 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacna1bO55017 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacna1bO55017 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacna1bO55017 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacna1bO55017 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna1bO55017 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna1bO55017 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacna1bO55017 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacna1bO55017 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacna1bO55017 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacna1bO55017 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacna1bO55017 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacna1bO55017 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacna1bO55017 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna1bO55017 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna1bO55017 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna1bO55017 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna1bO55017 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna1bO55017 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna1bO55017 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna1bO55017 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna1bO55017 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna1bO55017 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna1bO55017 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna1bO55017 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna1bO55017 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna1bO55017 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna1bO55017 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna1bO55017 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna1bO55017 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna1bO55017 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna1bO55017 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna1bO55017 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna1bO55017 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna1bO55017 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna1bO55017 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna1bO55017 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna1bO55017 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna1bO55017 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna1bO55017 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna1bO55017 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna1bO55017 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna1bO55017 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna1bO55017 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna1bO55017 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna1bO55017 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna1bO55017 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna1bO55017 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna1bO55017 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna1bO55017 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna1bO55017 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna1bO55017 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacna1bO55017 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacna1bO55017 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms