Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnfrsf18O35714 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnfrsf18O35714 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnfrsf18O35714 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnfrsf18O35714 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnfrsf18O35714 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnfrsf18O35714 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnfrsf18O35714 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnfrsf18O35714 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnfrsf18O35714 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnfrsf18O35714 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnfrsf18O35714 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnfrsf18O35714 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnfrsf18O35714 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnfrsf18O35714 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnfrsf18O35714 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnfrsf18O35714 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tnfrsf18O35714 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnfrsf18O35714 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnfrsf18O35714 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnfrsf18O35714 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnfrsf18O35714 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnfrsf18O35714 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnfrsf18O35714 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnfrsf18O35714 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnfrsf18O35714 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnfrsf18O35714 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnfrsf18O35714 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnfrsf18O35714 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnfrsf18O35714 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnfrsf18O35714 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnfrsf18O35714 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnfrsf18O35714 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnfrsf18O35714 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnfrsf18O35714 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnfrsf18O35714 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnfrsf18O35714 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tnfrsf18O35714 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnfrsf18O35714 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnfrsf18O35714 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnfrsf18O35714 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnfrsf18O35714 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnfrsf18O35714 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnfrsf18O35714 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnfrsf18O35714 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnfrsf18O35714 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnfrsf18O35714 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnfrsf18O35714 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnfrsf18O35714 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnfrsf18O35714 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnfrsf18O35714 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnfrsf18O35714 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnfrsf18O35714 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnfrsf18O35714 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnfrsf18O35714 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnfrsf18O35714 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnfrsf18O35714 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnfrsf18O35714 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnfrsf18O35714 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnfrsf18O35714 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnfrsf18O35714 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnfrsf18O35714 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnfrsf18O35714 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnfrsf18O35714 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tnfrsf18O35714 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnfrsf18O35714 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnfrsf18O35714 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnfrsf18O35714 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnfrsf18O35714 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnfrsf18O35714 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnfrsf18O35714 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnfrsf18O35714 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnfrsf18O35714 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnfrsf18O35714 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnfrsf18O35714 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnfrsf18O35714 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnfrsf18O35714 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnfrsf18O35714 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnfrsf18O35714 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnfrsf18O35714 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnfrsf18O35714 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnfrsf18O35714 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnfrsf18O35714 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnfrsf18O35714 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnfrsf18O35714 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnfrsf18O35714 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnfrsf18O35714 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnfrsf18O35714 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnfrsf18O35714 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnfrsf18O35714 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnfrsf18O35714 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnfrsf18O35714 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnfrsf18O35714 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnfrsf18O35714 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnfrsf18O35714 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnfrsf18O35714 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnfrsf18O35714 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnfrsf18O35714 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnfrsf18O35714 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnfrsf18O35714 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms