Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KeraO35367 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KeraO35367 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KeraO35367 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KeraO35367 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KeraO35367 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KeraO35367 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KeraO35367 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KeraO35367 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KeraO35367 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KeraO35367 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KeraO35367 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KeraO35367 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KeraO35367 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KeraO35367 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KeraO35367 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KeraO35367 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KeraO35367 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KeraO35367 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KeraO35367 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KeraO35367 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KeraO35367 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KeraO35367 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KeraO35367 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KeraO35367 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KeraO35367 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KeraO35367 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KeraO35367 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KeraO35367 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KeraO35367 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KeraO35367 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KeraO35367 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KeraO35367 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KeraO35367 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KeraO35367 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KeraO35367 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KeraO35367 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KeraO35367 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KeraO35367 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KeraO35367 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KeraO35367 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KeraO35367 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KeraO35367 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KeraO35367 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KeraO35367 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KeraO35367 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KeraO35367 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KeraO35367 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KeraO35367 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KeraO35367 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KeraO35367 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KeraO35367 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KeraO35367 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KeraO35367 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KeraO35367 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KeraO35367 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KeraO35367 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KeraO35367 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KeraO35367 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KeraO35367 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KeraO35367 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KeraO35367 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KeraO35367 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KeraO35367 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KeraO35367 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KeraO35367 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KeraO35367 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KeraO35367 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KeraO35367 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KeraO35367 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KeraO35367 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KeraO35367 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KeraO35367 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KeraO35367 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KeraO35367 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KeraO35367 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KeraO35367 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KeraO35367 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KeraO35367 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KeraO35367 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KeraO35367 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KeraO35367 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KeraO35367 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KeraO35367 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KeraO35367 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KeraO35367 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KeraO35367 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KeraO35367 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KeraO35367 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KeraO35367 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KeraO35367 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KeraO35367 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KeraO35367 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KeraO35367 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KeraO35367 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KeraO35367 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KeraO35367 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KeraO35367 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KeraO35367 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KeraO35367 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms