Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kpna6O35345 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kpna6O35345 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Kpna6O35345 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kpna6O35345 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kpna6O35345 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kpna6O35345 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kpna6O35345 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kpna6O35345 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kpna6O35345 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kpna6O35345 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kpna6O35345 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kpna6O35345 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kpna6O35345 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kpna6O35345 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kpna6O35345 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kpna6O35345 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kpna6O35345 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kpna6O35345 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kpna6O35345 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kpna6O35345 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kpna6O35345 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kpna6O35345 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kpna6O35345 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Kpna6O35345 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kpna6O35345 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kpna6O35345 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kpna6O35345 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kpna6O35345 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kpna6O35345 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kpna6O35345 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kpna6O35345 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kpna6O35345 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kpna6O35345 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kpna6O35345 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kpna6O35345 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kpna6O35345 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kpna6O35345 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kpna6O35345 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kpna6O35345 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kpna6O35345 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kpna6O35345 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kpna6O35345 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kpna6O35345 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Kpna6O35345 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kpna6O35345 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kpna6O35345 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kpna6O35345 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kpna6O35345 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kpna6O35345 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kpna6O35345 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kpna6O35345 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kpna6O35345 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kpna6O35345 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kpna6O35345 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Kpna6O35345 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kpna6O35345 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kpna6O35345 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kpna6O35345 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kpna6O35345 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kpna6O35345 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kpna6O35345 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kpna6O35345 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kpna6O35345 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kpna6O35345 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Kpna6O35345 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kpna6O35345 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kpna6O35345 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kpna6O35345 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kpna6O35345 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kpna6O35345 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Kpna6O35345 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kpna6O35345 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kpna6O35345 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kpna6O35345 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Kpna6O35345 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kpna6O35345 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kpna6O35345 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kpna6O35345 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kpna6O35345 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kpna6O35345 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kpna6O35345 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kpna6O35345 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kpna6O35345 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kpna6O35345 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Kpna6O35345 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kpna6O35345 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kpna6O35345 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kpna6O35345 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kpna6O35345 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kpna6O35345 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kpna6O35345 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kpna6O35345 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Kpna6O35345 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kpna6O35345 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kpna6O35345 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kpna6O35345 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kpna6O35345 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kpna6O35345 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kpna6O35345 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms