Protein–RNA interactions for Protein: O08908

Pik3r2, Phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3r2O08908 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pik3r2O08908 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pik3r2O08908 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pik3r2O08908 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pik3r2O08908 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pik3r2O08908 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pik3r2O08908 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pik3r2O08908 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pik3r2O08908 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pik3r2O08908 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pik3r2O08908 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pik3r2O08908 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pik3r2O08908 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pik3r2O08908 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pik3r2O08908 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pik3r2O08908 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pik3r2O08908 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pik3r2O08908 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pik3r2O08908 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pik3r2O08908 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pik3r2O08908 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pik3r2O08908 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pik3r2O08908 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pik3r2O08908 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pik3r2O08908 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pik3r2O08908 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pik3r2O08908 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pik3r2O08908 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pik3r2O08908 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pik3r2O08908 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pik3r2O08908 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pik3r2O08908 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pik3r2O08908 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pik3r2O08908 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pik3r2O08908 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pik3r2O08908 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pik3r2O08908 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pik3r2O08908 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pik3r2O08908 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pik3r2O08908 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pik3r2O08908 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pik3r2O08908 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pik3r2O08908 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pik3r2O08908 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pik3r2O08908 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pik3r2O08908 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pik3r2O08908 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pik3r2O08908 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pik3r2O08908 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pik3r2O08908 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pik3r2O08908 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pik3r2O08908 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pik3r2O08908 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3r2O08908 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3r2O08908 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3r2O08908 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3r2O08908 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3r2O08908 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3r2O08908 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3r2O08908 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3r2O08908 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3r2O08908 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pik3r2O08908 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pik3r2O08908 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pik3r2O08908 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pik3r2O08908 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pik3r2O08908 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pik3r2O08908 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pik3r2O08908 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pik3r2O08908 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pik3r2O08908 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pik3r2O08908 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pik3r2O08908 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pik3r2O08908 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pik3r2O08908 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pik3r2O08908 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pik3r2O08908 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pik3r2O08908 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pik3r2O08908 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pik3r2O08908 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pik3r2O08908 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pik3r2O08908 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pik3r2O08908 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pik3r2O08908 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pik3r2O08908 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pik3r2O08908 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pik3r2O08908 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pik3r2O08908 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pik3r2O08908 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pik3r2O08908 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pik3r2O08908 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pik3r2O08908 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pik3r2O08908 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pik3r2O08908 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pik3r2O08908 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pik3r2O08908 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pik3r2O08908 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pik3r2O08908 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pik3r2O08908 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pik3r2O08908 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms