Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Eftud2O08810 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Eftud2O08810 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Eftud2O08810 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Eftud2O08810 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Eftud2O08810 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Eftud2O08810 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Eftud2O08810 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Eftud2O08810 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Eftud2O08810 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Eftud2O08810 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Eftud2O08810 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Eftud2O08810 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Eftud2O08810 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Eftud2O08810 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Eftud2O08810 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Eftud2O08810 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Eftud2O08810 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Eftud2O08810 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Eftud2O08810 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Eftud2O08810 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Eftud2O08810 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Eftud2O08810 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Eftud2O08810 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Eftud2O08810 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Eftud2O08810 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Eftud2O08810 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Eftud2O08810 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Eftud2O08810 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Eftud2O08810 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Eftud2O08810 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Eftud2O08810 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Eftud2O08810 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Eftud2O08810 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Eftud2O08810 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Eftud2O08810 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Eftud2O08810 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Eftud2O08810 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Eftud2O08810 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Eftud2O08810 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Eftud2O08810 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Eftud2O08810 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Eftud2O08810 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Eftud2O08810 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Eftud2O08810 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Eftud2O08810 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Eftud2O08810 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Eftud2O08810 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Eftud2O08810 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Eftud2O08810 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Eftud2O08810 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Eftud2O08810 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Eftud2O08810 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Eftud2O08810 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Eftud2O08810 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Eftud2O08810 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Eftud2O08810 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Eftud2O08810 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Eftud2O08810 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Eftud2O08810 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Eftud2O08810 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Eftud2O08810 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Eftud2O08810 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Eftud2O08810 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Eftud2O08810 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Eftud2O08810 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Eftud2O08810 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Eftud2O08810 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Eftud2O08810 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Eftud2O08810 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Eftud2O08810 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Eftud2O08810 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Eftud2O08810 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Eftud2O08810 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Eftud2O08810 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Eftud2O08810 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Eftud2O08810 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Eftud2O08810 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Eftud2O08810 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Eftud2O08810 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Eftud2O08810 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Eftud2O08810 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Eftud2O08810 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Eftud2O08810 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Eftud2O08810 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Eftud2O08810 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Eftud2O08810 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Eftud2O08810 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Eftud2O08810 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Eftud2O08810 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Eftud2O08810 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Eftud2O08810 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Eftud2O08810 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Eftud2O08810 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Eftud2O08810 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Eftud2O08810 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Eftud2O08810 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Eftud2O08810 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Eftud2O08810 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Eftud2O08810 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.8 ms