Protein–RNA interactions for Protein: O08746

Matn2, Matrilin-2, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matn2O08746 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Matn2O08746 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Matn2O08746 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Matn2O08746 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Matn2O08746 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Matn2O08746 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Matn2O08746 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Matn2O08746 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Matn2O08746 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Matn2O08746 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Matn2O08746 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Matn2O08746 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Matn2O08746 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Matn2O08746 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Matn2O08746 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Matn2O08746 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Matn2O08746 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Matn2O08746 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Matn2O08746 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Matn2O08746 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Matn2O08746 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Matn2O08746 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Matn2O08746 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Matn2O08746 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Matn2O08746 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Matn2O08746 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Matn2O08746 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Matn2O08746 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Matn2O08746 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Matn2O08746 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Matn2O08746 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Matn2O08746 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Matn2O08746 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Matn2O08746 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Matn2O08746 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Matn2O08746 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Matn2O08746 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Matn2O08746 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Matn2O08746 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Matn2O08746 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Matn2O08746 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Matn2O08746 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Matn2O08746 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Matn2O08746 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Matn2O08746 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Matn2O08746 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Matn2O08746 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Matn2O08746 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Matn2O08746 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Matn2O08746 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Matn2O08746 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Matn2O08746 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Matn2O08746 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Matn2O08746 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Matn2O08746 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Matn2O08746 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Matn2O08746 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Matn2O08746 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Matn2O08746 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Matn2O08746 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Matn2O08746 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Matn2O08746 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Matn2O08746 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Matn2O08746 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Matn2O08746 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Matn2O08746 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Matn2O08746 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Matn2O08746 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Matn2O08746 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Matn2O08746 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Matn2O08746 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Matn2O08746 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Matn2O08746 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Matn2O08746 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Matn2O08746 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Matn2O08746 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Matn2O08746 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Matn2O08746 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Matn2O08746 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Matn2O08746 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Matn2O08746 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Matn2O08746 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Matn2O08746 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Matn2O08746 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Matn2O08746 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Matn2O08746 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Matn2O08746 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Matn2O08746 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Matn2O08746 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Matn2O08746 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Matn2O08746 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Matn2O08746 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Matn2O08746 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Matn2O08746 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Matn2O08746 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Matn2O08746 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Matn2O08746 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Matn2O08746 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Matn2O08746 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Matn2O08746 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms