Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smim22J3QP37 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smim22J3QP37 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smim22J3QP37 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smim22J3QP37 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smim22J3QP37 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smim22J3QP37 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Smim22J3QP37 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smim22J3QP37 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Smim22J3QP37 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smim22J3QP37 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smim22J3QP37 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smim22J3QP37 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smim22J3QP37 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smim22J3QP37 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smim22J3QP37 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Smim22J3QP37 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smim22J3QP37 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smim22J3QP37 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Smim22J3QP37 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smim22J3QP37 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Smim22J3QP37 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smim22J3QP37 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smim22J3QP37 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smim22J3QP37 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smim22J3QP37 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smim22J3QP37 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smim22J3QP37 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smim22J3QP37 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smim22J3QP37 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smim22J3QP37 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smim22J3QP37 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smim22J3QP37 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smim22J3QP37 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smim22J3QP37 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smim22J3QP37 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smim22J3QP37 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smim22J3QP37 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smim22J3QP37 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Smim22J3QP37 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smim22J3QP37 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smim22J3QP37 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Smim22J3QP37 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smim22J3QP37 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smim22J3QP37 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smim22J3QP37 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smim22J3QP37 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smim22J3QP37 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smim22J3QP37 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smim22J3QP37 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smim22J3QP37 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smim22J3QP37 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smim22J3QP37 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smim22J3QP37 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smim22J3QP37 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smim22J3QP37 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smim22J3QP37 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smim22J3QP37 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smim22J3QP37 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smim22J3QP37 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smim22J3QP37 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smim22J3QP37 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Smim22J3QP37 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Smim22J3QP37 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smim22J3QP37 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Smim22J3QP37 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smim22J3QP37 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smim22J3QP37 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smim22J3QP37 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smim22J3QP37 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smim22J3QP37 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smim22J3QP37 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smim22J3QP37 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smim22J3QP37 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smim22J3QP37 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Smim22J3QP37 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Smim22J3QP37 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smim22J3QP37 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smim22J3QP37 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smim22J3QP37 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smim22J3QP37 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smim22J3QP37 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smim22J3QP37 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smim22J3QP37 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smim22J3QP37 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smim22J3QP37 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smim22J3QP37 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smim22J3QP37 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smim22J3QP37 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smim22J3QP37 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smim22J3QP37 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smim22J3QP37 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smim22J3QP37 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smim22J3QP37 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smim22J3QP37 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smim22J3QP37 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smim22J3QP37 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smim22J3QP37 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smim22J3QP37 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smim22J3QP37 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms