Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm17535J3KMR8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm17535J3KMR8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm17535J3KMR8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm17535J3KMR8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm17535J3KMR8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm17535J3KMR8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm17535J3KMR8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm17535J3KMR8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm17535J3KMR8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm17535J3KMR8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm17535J3KMR8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm17535J3KMR8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm17535J3KMR8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm17535J3KMR8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm17535J3KMR8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm17535J3KMR8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm17535J3KMR8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm17535J3KMR8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm17535J3KMR8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm17535J3KMR8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm17535J3KMR8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm17535J3KMR8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm17535J3KMR8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm17535J3KMR8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm17535J3KMR8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm17535J3KMR8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm17535J3KMR8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm17535J3KMR8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm17535J3KMR8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm17535J3KMR8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm17535J3KMR8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm17535J3KMR8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm17535J3KMR8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm17535J3KMR8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm17535J3KMR8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gm17535J3KMR8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm17535J3KMR8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm17535J3KMR8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm17535J3KMR8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm17535J3KMR8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm17535J3KMR8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm17535J3KMR8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm17535J3KMR8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm17535J3KMR8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm17535J3KMR8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm17535J3KMR8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm17535J3KMR8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm17535J3KMR8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm17535J3KMR8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm17535J3KMR8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm17535J3KMR8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm17535J3KMR8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm17535J3KMR8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm17535J3KMR8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm17535J3KMR8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm17535J3KMR8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm17535J3KMR8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm17535J3KMR8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm17535J3KMR8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm17535J3KMR8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm17535J3KMR8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm17535J3KMR8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm17535J3KMR8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm17535J3KMR8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm17535J3KMR8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm17535J3KMR8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm17535J3KMR8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm17535J3KMR8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm17535J3KMR8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm17535J3KMR8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm17535J3KMR8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm17535J3KMR8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm17535J3KMR8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm17535J3KMR8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm17535J3KMR8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm17535J3KMR8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm17535J3KMR8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm17535J3KMR8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm17535J3KMR8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm17535J3KMR8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gm17535J3KMR8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm17535J3KMR8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm17535J3KMR8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm17535J3KMR8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm17535J3KMR8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm17535J3KMR8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm17535J3KMR8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm17535J3KMR8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm17535J3KMR8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm17535J3KMR8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm17535J3KMR8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm17535J3KMR8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm17535J3KMR8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm17535J3KMR8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm17535J3KMR8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm17535J3KMR8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm17535J3KMR8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm17535J3KMR8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm17535J3KMR8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms