Protein–RNA interactions for Protein: G5E8S3

E230025N22Rik, Riken cDNA E230025N22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E230025N22RikG5E8S3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
E230025N22RikG5E8S3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
E230025N22RikG5E8S3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
E230025N22RikG5E8S3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E230025N22RikG5E8S3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E230025N22RikG5E8S3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E230025N22RikG5E8S3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
E230025N22RikG5E8S3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
E230025N22RikG5E8S3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
E230025N22RikG5E8S3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
E230025N22RikG5E8S3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E230025N22RikG5E8S3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
E230025N22RikG5E8S3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E230025N22RikG5E8S3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E230025N22RikG5E8S3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E230025N22RikG5E8S3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E230025N22RikG5E8S3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E230025N22RikG5E8S3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E230025N22RikG5E8S3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
E230025N22RikG5E8S3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
E230025N22RikG5E8S3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E230025N22RikG5E8S3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E230025N22RikG5E8S3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E230025N22RikG5E8S3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E230025N22RikG5E8S3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E230025N22RikG5E8S3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E230025N22RikG5E8S3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E230025N22RikG5E8S3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
E230025N22RikG5E8S3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E230025N22RikG5E8S3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E230025N22RikG5E8S3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E230025N22RikG5E8S3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
E230025N22RikG5E8S3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
E230025N22RikG5E8S3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E230025N22RikG5E8S3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E230025N22RikG5E8S3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E230025N22RikG5E8S3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
E230025N22RikG5E8S3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E230025N22RikG5E8S3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
E230025N22RikG5E8S3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E230025N22RikG5E8S3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E230025N22RikG5E8S3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E230025N22RikG5E8S3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
E230025N22RikG5E8S3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E230025N22RikG5E8S3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E230025N22RikG5E8S3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
E230025N22RikG5E8S3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
E230025N22RikG5E8S3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
E230025N22RikG5E8S3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
E230025N22RikG5E8S3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E230025N22RikG5E8S3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E230025N22RikG5E8S3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
E230025N22RikG5E8S3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
E230025N22RikG5E8S3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E230025N22RikG5E8S3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E230025N22RikG5E8S3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E230025N22RikG5E8S3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E230025N22RikG5E8S3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
E230025N22RikG5E8S3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E230025N22RikG5E8S3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
E230025N22RikG5E8S3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E230025N22RikG5E8S3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E230025N22RikG5E8S3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
E230025N22RikG5E8S3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E230025N22RikG5E8S3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E230025N22RikG5E8S3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E230025N22RikG5E8S3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E230025N22RikG5E8S3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
E230025N22RikG5E8S3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E230025N22RikG5E8S3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E230025N22RikG5E8S3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E230025N22RikG5E8S3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E230025N22RikG5E8S3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
E230025N22RikG5E8S3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E230025N22RikG5E8S3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E230025N22RikG5E8S3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E230025N22RikG5E8S3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
E230025N22RikG5E8S3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E230025N22RikG5E8S3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E230025N22RikG5E8S3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E230025N22RikG5E8S3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E230025N22RikG5E8S3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E230025N22RikG5E8S3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E230025N22RikG5E8S3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E230025N22RikG5E8S3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E230025N22RikG5E8S3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E230025N22RikG5E8S3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E230025N22RikG5E8S3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
E230025N22RikG5E8S3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E230025N22RikG5E8S3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E230025N22RikG5E8S3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E230025N22RikG5E8S3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E230025N22RikG5E8S3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E230025N22RikG5E8S3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E230025N22RikG5E8S3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E230025N22RikG5E8S3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
E230025N22RikG5E8S3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
E230025N22RikG5E8S3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
E230025N22RikG5E8S3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E230025N22RikG5E8S3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms