Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r58G3X9U3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r58G3X9U3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r58G3X9U3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r58G3X9U3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r58G3X9U3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r58G3X9U3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r58G3X9U3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r58G3X9U3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r58G3X9U3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r58G3X9U3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r58G3X9U3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r58G3X9U3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r58G3X9U3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r58G3X9U3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r58G3X9U3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r58G3X9U3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r58G3X9U3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r58G3X9U3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r58G3X9U3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r58G3X9U3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r58G3X9U3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r58G3X9U3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r58G3X9U3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r58G3X9U3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r58G3X9U3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r58G3X9U3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r58G3X9U3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r58G3X9U3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r58G3X9U3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r58G3X9U3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r58G3X9U3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r58G3X9U3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r58G3X9U3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r58G3X9U3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r58G3X9U3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r58G3X9U3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r58G3X9U3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r58G3X9U3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r58G3X9U3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r58G3X9U3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r58G3X9U3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r58G3X9U3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r58G3X9U3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r58G3X9U3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r58G3X9U3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r58G3X9U3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r58G3X9U3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r58G3X9U3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r58G3X9U3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r58G3X9U3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r58G3X9U3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r58G3X9U3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r58G3X9U3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r58G3X9U3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r58G3X9U3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r58G3X9U3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r58G3X9U3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r58G3X9U3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r58G3X9U3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r58G3X9U3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r58G3X9U3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r58G3X9U3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r58G3X9U3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r58G3X9U3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r58G3X9U3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r58G3X9U3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vmn1r58G3X9U3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r58G3X9U3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r58G3X9U3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r58G3X9U3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r58G3X9U3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r58G3X9U3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r58G3X9U3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r58G3X9U3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r58G3X9U3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r58G3X9U3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r58G3X9U3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r58G3X9U3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r58G3X9U3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r58G3X9U3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r58G3X9U3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r58G3X9U3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r58G3X9U3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r58G3X9U3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r58G3X9U3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r58G3X9U3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r58G3X9U3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r58G3X9U3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r58G3X9U3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r58G3X9U3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r58G3X9U3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r58G3X9U3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r58G3X9U3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r58G3X9U3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r58G3X9U3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r58G3X9U3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r58G3X9U3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms