Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Igkv1-99F6XWB2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igkv1-99F6XWB2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igkv1-99F6XWB2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Igkv1-99F6XWB2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igkv1-99F6XWB2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igkv1-99F6XWB2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igkv1-99F6XWB2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igkv1-99F6XWB2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igkv1-99F6XWB2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igkv1-99F6XWB2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Igkv1-99F6XWB2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igkv1-99F6XWB2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igkv1-99F6XWB2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igkv1-99F6XWB2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igkv1-99F6XWB2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igkv1-99F6XWB2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igkv1-99F6XWB2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igkv1-99F6XWB2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igkv1-99F6XWB2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igkv1-99F6XWB2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igkv1-99F6XWB2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igkv1-99F6XWB2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igkv1-99F6XWB2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Igkv1-99F6XWB2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Igkv1-99F6XWB2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igkv1-99F6XWB2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igkv1-99F6XWB2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igkv1-99F6XWB2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igkv1-99F6XWB2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igkv1-99F6XWB2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igkv1-99F6XWB2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igkv1-99F6XWB2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igkv1-99F6XWB2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igkv1-99F6XWB2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igkv1-99F6XWB2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igkv1-99F6XWB2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igkv1-99F6XWB2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igkv1-99F6XWB2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igkv1-99F6XWB2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igkv1-99F6XWB2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igkv1-99F6XWB2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igkv1-99F6XWB2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Igkv1-99F6XWB2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Igkv1-99F6XWB2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igkv1-99F6XWB2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igkv1-99F6XWB2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igkv1-99F6XWB2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igkv1-99F6XWB2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igkv1-99F6XWB2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igkv1-99F6XWB2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igkv1-99F6XWB2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igkv1-99F6XWB2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igkv1-99F6XWB2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Igkv1-99F6XWB2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igkv1-99F6XWB2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igkv1-99F6XWB2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igkv1-99F6XWB2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Igkv1-99F6XWB2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Igkv1-99F6XWB2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Igkv1-99F6XWB2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Igkv1-99F6XWB2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igkv1-99F6XWB2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Igkv1-99F6XWB2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igkv1-99F6XWB2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igkv1-99F6XWB2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igkv1-99F6XWB2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igkv1-99F6XWB2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Igkv1-99F6XWB2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igkv1-99F6XWB2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Igkv1-99F6XWB2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igkv1-99F6XWB2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Igkv1-99F6XWB2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igkv1-99F6XWB2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igkv1-99F6XWB2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igkv1-99F6XWB2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igkv1-99F6XWB2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igkv1-99F6XWB2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igkv1-99F6XWB2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igkv1-99F6XWB2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igkv1-99F6XWB2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igkv1-99F6XWB2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igkv1-99F6XWB2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igkv1-99F6XWB2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Igkv1-99F6XWB2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Igkv1-99F6XWB2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Igkv1-99F6XWB2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Igkv1-99F6XWB2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Igkv1-99F6XWB2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Igkv1-99F6XWB2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Igkv1-99F6XWB2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Igkv1-99F6XWB2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Igkv1-99F6XWB2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Igkv1-99F6XWB2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Igkv1-99F6XWB2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Igkv1-99F6XWB2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Igkv1-99F6XWB2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Igkv1-99F6XWB2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Igkv1-99F6XWB2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms