Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Crocc2F6XLV1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
Crocc2F6XLV1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Crocc2F6XLV1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Crocc2F6XLV1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Crocc2F6XLV1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Crocc2F6XLV1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Crocc2F6XLV1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Crocc2F6XLV1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Crocc2F6XLV1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Crocc2F6XLV1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Crocc2F6XLV1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Crocc2F6XLV1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Crocc2F6XLV1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Crocc2F6XLV1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Crocc2F6XLV1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Crocc2F6XLV1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
Crocc2F6XLV1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Crocc2F6XLV1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Crocc2F6XLV1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Crocc2F6XLV1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Crocc2F6XLV1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Crocc2F6XLV1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
Crocc2F6XLV1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Crocc2F6XLV1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Crocc2F6XLV1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Crocc2F6XLV1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Crocc2F6XLV1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
Crocc2F6XLV1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
Crocc2F6XLV1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Crocc2F6XLV1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Crocc2F6XLV1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Crocc2F6XLV1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
Crocc2F6XLV1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Crocc2F6XLV1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.73
Crocc2F6XLV1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Crocc2F6XLV1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Crocc2F6XLV1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Crocc2F6XLV1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Crocc2F6XLV1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC38.3■■■■□ 3.72
Crocc2F6XLV1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Crocc2F6XLV1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Crocc2F6XLV1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
Crocc2F6XLV1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Crocc2F6XLV1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Crocc2F6XLV1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Crocc2F6XLV1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Crocc2F6XLV1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Crocc2F6XLV1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Crocc2F6XLV1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Crocc2F6XLV1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Crocc2F6XLV1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Crocc2F6XLV1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Crocc2F6XLV1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Crocc2F6XLV1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
Crocc2F6XLV1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
Crocc2F6XLV1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Crocc2F6XLV1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Crocc2F6XLV1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Crocc2F6XLV1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Crocc2F6XLV1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Crocc2F6XLV1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Crocc2F6XLV1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Crocc2F6XLV1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Crocc2F6XLV1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Crocc2F6XLV1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Crocc2F6XLV1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Crocc2F6XLV1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Crocc2F6XLV1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Crocc2F6XLV1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
Crocc2F6XLV1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.7
Crocc2F6XLV1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Crocc2F6XLV1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Crocc2F6XLV1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
Crocc2F6XLV1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Crocc2F6XLV1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
Crocc2F6XLV1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Crocc2F6XLV1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Crocc2F6XLV1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
Crocc2F6XLV1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Crocc2F6XLV1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Crocc2F6XLV1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Crocc2F6XLV1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Crocc2F6XLV1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
Crocc2F6XLV1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Crocc2F6XLV1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
Crocc2F6XLV1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Crocc2F6XLV1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Crocc2F6XLV1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Crocc2F6XLV1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Crocc2F6XLV1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Crocc2F6XLV1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Crocc2F6XLV1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Crocc2F6XLV1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Crocc2F6XLV1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
Crocc2F6XLV1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
Crocc2F6XLV1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Crocc2F6XLV1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Crocc2F6XLV1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Crocc2F6XLV1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms