Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SmgcF6VRN1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SmgcF6VRN1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SmgcF6VRN1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SmgcF6VRN1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SmgcF6VRN1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SmgcF6VRN1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SmgcF6VRN1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SmgcF6VRN1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SmgcF6VRN1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SmgcF6VRN1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SmgcF6VRN1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SmgcF6VRN1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SmgcF6VRN1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SmgcF6VRN1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SmgcF6VRN1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SmgcF6VRN1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SmgcF6VRN1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SmgcF6VRN1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SmgcF6VRN1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SmgcF6VRN1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SmgcF6VRN1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SmgcF6VRN1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SmgcF6VRN1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SmgcF6VRN1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SmgcF6VRN1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SmgcF6VRN1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SmgcF6VRN1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SmgcF6VRN1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SmgcF6VRN1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SmgcF6VRN1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SmgcF6VRN1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SmgcF6VRN1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SmgcF6VRN1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SmgcF6VRN1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SmgcF6VRN1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SmgcF6VRN1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SmgcF6VRN1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SmgcF6VRN1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SmgcF6VRN1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SmgcF6VRN1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SmgcF6VRN1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SmgcF6VRN1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SmgcF6VRN1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SmgcF6VRN1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SmgcF6VRN1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SmgcF6VRN1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SmgcF6VRN1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SmgcF6VRN1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SmgcF6VRN1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SmgcF6VRN1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SmgcF6VRN1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SmgcF6VRN1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SmgcF6VRN1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SmgcF6VRN1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SmgcF6VRN1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SmgcF6VRN1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SmgcF6VRN1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SmgcF6VRN1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SmgcF6VRN1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SmgcF6VRN1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SmgcF6VRN1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SmgcF6VRN1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SmgcF6VRN1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SmgcF6VRN1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SmgcF6VRN1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SmgcF6VRN1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SmgcF6VRN1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SmgcF6VRN1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SmgcF6VRN1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SmgcF6VRN1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SmgcF6VRN1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SmgcF6VRN1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SmgcF6VRN1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SmgcF6VRN1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SmgcF6VRN1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SmgcF6VRN1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SmgcF6VRN1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SmgcF6VRN1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SmgcF6VRN1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SmgcF6VRN1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SmgcF6VRN1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SmgcF6VRN1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SmgcF6VRN1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SmgcF6VRN1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SmgcF6VRN1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SmgcF6VRN1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SmgcF6VRN1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SmgcF6VRN1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SmgcF6VRN1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SmgcF6VRN1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SmgcF6VRN1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SmgcF6VRN1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SmgcF6VRN1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SmgcF6VRN1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SmgcF6VRN1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SmgcF6VRN1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SmgcF6VRN1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SmgcF6VRN1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SmgcF6VRN1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms